Biopolym. Cell. 1994; 10(1):41-46.
Вивчення конформаційних характеристик транскрипційно активного та репресованого хроматину за допомогою флюоресцентных зондів
1Примак Р. Г., 1Горюшко Г. Г., 1Левицький Є. Л., 1Губський Ю. І., 1Новикова С. М.
  1. Інститут фармакології та токсикології АМН України
    вул. Ежена Потьє, 14, Київ, Україна, 03057

Abstract

За допомогою флюоресцентних зондів пірена i 1,8-АНС вивчено конформаційні ха­рактеристики фракцій активного та репресованого хроматину iз печінки щурів. По­казано, що між хромофорами білків хроматину i введеними до розчину молекулами пірена спостерігається індуктивно-резонансний перенос енергії (ІРПЕ), який дає уявлення про деякі структурні параметри білок-лідної взаємодії. Розраховано імовірність переносу енергії з білкових флюорофорів на пірен та частку триптофанових залишків білків, що беруть участь у ІРПЕ. Помітні розбіжності у значениях згаданих параметрів для розглянутих фракщй хроматину дозволили зробити висновок про більш пухке укладання активної фракції, що є необхідною передумовою для запуску i здійснення процесу транскрипції, а також про залежність його відхаракте­ру взаемодії білків i ліпідів у хроматині.

References

[1] Vladimirov YuA., Dobretsov GE. Fluorescent Probes in the study of biological membranes. Moscow: Nauka, 1980. 320 p.
[2] Dobretsov GE. Fluorescent probes in the study of cell membranes and lipoproteins. Moscow: Nauka, 1989. 277 p.
[3] J. Lakovich, Principles of Fluorescence Spectroscopy. Plenum, New York, 1986.
[4] Chikhirzhina GI, Domkina LK, Chigareva NG, Ashmarin IP. Solubilization of chromatin by an endogenous enzymic Ca2+, Mg2+-dependent factor. Activity of residual chromatin. Mol Biol (Mosk). 1976;10(6):1303-10.
[5] Tsanev RG, Markov GG. On the problem of quantitative spectrophotometric determination of nucleic acid. Biokhimiia. 1960;25:151-9.
[6] Gubskiĭ IuI, Levitskii EL, Gol'dshteĭn NB, Mozzhukhina TG, Litoshenko AIa, Novikova SN. Functional activity of fractionated chromatin from rat liver upon a single administration of carbon tetrachloride. Vopr Med Khim. 1989;35(4):119-24.
[7] Gubskiĭ IuI, Levitskii EL, Primak RG, Golubov MI, Novikova SN. Conformational characteristics and packing of endogenous lipid fractions of transcriptionally active and repressed chromatin. Ukr Biokhim Zh. 1991;63(2):83-9.
[8] Gubskiĭ IuI, Levitskiĭ EL, Chabannyĭ VN, Gol'dshteĭn NB, Kapralov AA, Petrova GV, Donchenko GV, Volkov GL, Litoshenko AIa. Changes in protein, lipid composition, DNA- and RNA- polymerase activity of the chromatin fraction and the nuclear matrix of the rat liver in hypovitaminosis E. Ukr Biokhim Zh. 1990;62(6):22-30.
[9] Kraevskii VA, Krylov DIu, Razin SV, Mikhailov VS. Analysis of the conformational mobility of DNA in transcriptionally-active chromatin. Biofizika. 1993;38(1):108-16.
[10] Dobretsov GE. Fluorescent probe study of the spatial structure of membranes and lipoproteins. Ukr Biokhim Zh. 1984;56(2):211-22.
[11] Demchenko AP. Luminescence and protein structure dynamics . Kiev Naukova. Dumka, 1988. 280 p.
[12] Vekshin NL. Use of pyrene as a luminescence indicator of the viscosity of model and biological membranes. Nauchnye Doki Vyss Shkoly Biol Nauki. 1987;(11):59-66.
[13] Levitsky E. L., Gubsky Yu. I., Chabanny V. N., Volkov G. L., Novikova S. N. Biochemical characteristics of the rat liver transcriptionally active and repressed chromatin. Biopolym Cell. 1993; 9(6):13-21.