Передбачення вторинної структури білків модифікованим GUHA-методом

Автор(и)

  • А. В. Братусь Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 Автор
  • С. З. Мальченко Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 Автор
  • М. О. Чащин Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 Автор

DOI:

https://doi.org/10.7124/bc.000373

Анотація

У роботі запропоновано новий метод передбачення вторинної структури білка, що базується на відомому в галузі експертних систем GUHA-методі. Навчання та передбачення грунтуються на інформації про вторинну структуру 108 білків (біля 20000 амінокислотних залишків) з рентгенострухтурним розділенням менше 0,2 нм. Середня точність передбачення з використаного в роботі банку даних складає для α-спіралі - 74 %, β-складки – 67 %, нерегулярної структури – 71 %; загальна – 68%

Посилання

Sternberg MJ, Islam SA. Local protein sequence similarity does not imply a structural relationship. Protein Eng. 1990;4(2):125-31.

Hajek P, Havranek T. Mechanizing Hypothesis Formation: Mathematical Foundations for a General Theory. Springer; 1978 416 p.

Maltchenko SZ, Chaschin NA. Prediction of protein secondary structures. Biopolym Cell. 1992; 8(5):21-31.

biopolym.cell-1993-9-5-cover.png

Завантаження

Опубліковано

1993-09-20

Номер

Том 9 № 5 (1993)

Розділ

Структура та функції біополімерів