Реалістичний асортимент нових еталонів метагеноміки з різноманітними біологічними та технологічними характеристиками

Автор(и)

  • Н. К. Шарма Університет Південної Каліфорнії Лос-Анджелес, штат Каліфорнія, США, 90007 Автор
  • К. Чхугані Університет Південної Каліфорнії Лос-Анджелес, штат Каліфорнія, США, 90007 Автор
  • В. Мунтяну Технічний університет Молдови 168, Бул. Стефан чел Маре, Кишинів, Республіка Молдова, MD–2004 Автор
  • П. Скумс Університет штату Джорджія Атланта, штат Джорджія, США, 30302,; Університет Коннектикуту 352, Менсфілд Роуд, Сторрс, Коннектикут, США, 06269 Автор
  • А. Зеліковський Університет штату Джорджія Атланта, штат Джорджія, США, 30302, Автор
  • С. Мангул Університет Південної Каліфорнії Лос-Анджелес, штат Каліфорнія, США, 90007 Автор

DOI:

https://doi.org/10.7124/bc.000AFF

Ключові слова:

метагеноміка, генерація тесту продуктивності, MetaWiz, мікробні геноми, виправлення помилок

Анотація

Мета. Вирішити проблему дефіциту високоякісних експериментальних тестів у метагеноміці шляхом розробки економічно ефективного, напівреального інструменту генерації еталонів, MetaWiz, який може модифікувати існуючі експериментальні дані для створення різноманітних та реалістичних метагеномних еталонів. Висновки. MetaWiz пропонує економічно ефективне рішення проблеми створення високоякісних тестів у метагеноміці. Здатність інструменту створювати напівреальні контрольні показники на основі наявних експериментальних даних зберігає важливі технологічні та біологічні аспекти, надаючи переваги перед суто обчислювальними симуляціями. Цей підхід може бути поширений за межі вірусних послідовностей на різні дані секвенування, підвищуючи всебічність порівняльних досліджень метагеноміки в різних біологічних контекстах.

Завантаження

Опубліковано

2024-09-10

Номер

Розділ

Хроніка та інформація