Передбачувані G-квадруплекси в геномі нетрадиційного ретровірусу пінистого вірусу великої рогатої худоби

Анотація

Мета. Метою даного дослідження було визначення таких консервативних non-B-DNA-структур, як консервативні G-квадруплекси, які можуть утворюватися двома і трьома G-квартетами в мРНК, смислових і антисмислових ланцюгах провірусної ДНК вірусу пінистості великої рогатої худоби (BFV). Висновки. Консервативні G4 нерівномірно розподілені по всьому геному BFV. Відмінною особливістю геномної організації BFV є той факт, що антисмисловий ланцюг провірусної ДНК BFV характеризується значно більшою щільністю G-квадруплексів у порівнянні з одним із смислових ланцюгів. Програмне забезпечення QGRS Mapper виявляє значно більшу кількість потенційних G4 (34 G4 в антисмисловому ланцюгу провірусної ДНК BFV) порівняно з програмним забезпеченням G4Hunter (7 G4).