Biopolym. Cell. 1991; 7(5):5-14.
Огляди
Моделювання стекінгу алкалоїдів пуринового ряду методом Монте-Карло
1Данілов В. І., 1Слюсарчук О. Н., 2Полтєв В. І., 3Брикманн Ю. А. В., 4Алдерфер Дж. Л., 3Вольман Р. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики АН УСРС
    Київ, СРСР
  2. Інститут біологічної фізики АН СРСР
    Пущино, Московська обл., СРСР
  3. Інститут фізичної хімії, Вища технічна школа Дармштадта
    Дармштадт, ФРН
  4. Раковий інститут ім. Розвелл Парк
    вул. Елм і Карлтон, Баффало, Нью-Йорк, США, 14 263
Представлені результати моделювання гідратації мономірних та можливих купкоподібних дімерних форм алкалоїдів пуринового ряду методом Монте-Карло в кластері із 200 молекул. Вивчення різних форм купкоподібних пуринових дімерів показало, що для кофеїну існує один, для теофіліну – два, для теоброміну – чотири енергетично вигідних дімера. Знайдено, що основним фактором, стабілізуючим вигідні купки, є змі-на взаємодії між молекулами води, яка пов'язана із зміною структури води навколо мономірів при їх асоціації. За допомогою аналізу енергетичних та структурних характеристик гідратації виявлено, що процес асоціації молекул алкалоїдів у воді тісно пов'язаний з гідрофобним характером метильних груп. Зміна гідратних властивостей алкалоїдів пуринового ряду при переході від мономірних форм до дімерних може бути вирішальним фактором при взаємодії з біополімерами в первинних механізмах їх фармакологічної дії.