Biopolym. Cell. 2016; 32(3):235-241.
Віруси та клітина
Встановлення штамової приналежності українських ізолятів вірусу жовтої мозаїки цукіні та їх поширення на території України
1, 2Цвігун В. О., 2Руднєва Т. О., 1Шевченко Т. П., 1Будзанівська І. Г., 1Поліщук В. П.
  1. Навчально-науковий центр «Інститут біології»
    Київського національного університету імені Тараса Шевченка
    вул. Володимирська, 64/13, Київ, Україна, 01601
  2. Інститут агроекології і природокористування НААН України
    вул. Метрологічна 12, Київ, Україна, 03680

Abstract

Мета. Встановити штамову приналежність українських ізолятів вірусу жовтої мозаїки цукіні та дослідити їх поширення на території України. Методи. У роботі були використані наступні методи: візуальна діагностика, імуноферментний аналіз, ЗТ-ПЛР, сиквенування та філогенетичний аналіз. Результати. Перевірено рослини родини Cucurbitaceae на наявність антигенів вірусу жовтої мозаїки цукіні (ВЖМЦ). Встановлено, що 41 % перевірених рослин родини Cucurbitaceae уражені вірусом жовтої мозаїки цукіні. Вірусінфіковані рослини були наявні в агроценозах Вінницької, Запорізької, Київської, Полтавської та Черкаської областей. У результаті проведення ЗТ–ПЛР було отримано продукти ампліфікації розміром 605 п.о., що відповідає за розміром ділянці геному, яка кодує Nib/CP вірусу жовтої мозаїки цукіні. За результатами даних сиквенсу побудувано філогенетичне дерево виділених ізолятів ZYMV. Висновки. Ідентифікація інфікованих рослин у 5 із 9 обстежуваних агроценозів показала широке розповсюдження ZYMV в Україні. Топологія філогенетичного дерева показує, що ізоляти ZYMV формують три групи. Філогенетичне положення на дереві українських ізолятів ZYMV показує їх приналежність до групи А підгрупи 1. Ця група є найбільш чисельною та її представники мають широке географічне поширення. Ізоляти ZYMV, що циркулюють в Україні, виявилися близькоспоріднені між собою. Відсоток ідентичності між ними знаходиться в діапазоні від 99,7 до 100. Дані ізоляти ZYMV мають спільне походження з європейськими ізолятами з Австрії (AJ420017), Словенії (AJ420018), Сербії (HM072432), Угорщини (AJ459955), Словаччини (DQ124239). Відсоток ідентичності між українськими та європейськими ізолятами знаходиться в межах від 94,3 до 100.
Keywords: вірус жовтої мозаїки цукіні, агроценози, штами, філогенетичний аналіз

References

[1] Desbiez C, Lecoq H. Zucchini yellow mosaic virus. Plant Pathol. 1997; 46(6):809–29.
[2] Fauquet C, Mayo MA, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA. Virus taxonomy. VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Academic Press, 2004. 1162 p.
[3] Gal-On A. Zucchini yellow mosaic virus: insect transmission and pathogenicity -the tails of two proteins. Mol Plant Pathol. 2007;8(2):139-50.
[4] Rudneva TO, Shevchenko TP, Boyko AL. Vlastyvosti virusu zhovtoi mozaiky cukkini, izolovanogo z roslyn rodyny Cucurbitaceae. Agroekologichnyy Zhurnal. 2008. Sp ed:205-7.
[5] Desbiez C, Wipf-Scheibel C, Lecoq H. Biological and serological variability, evolution and molecular epidemiology of Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV, Potyvirus) with special reference to Caribbean islands. Virus Res. 2002;85(1):5-16.
[6] Yakoubi S, Desbiez C, Fakhfakh H, Wipf-Scheibel C, FabreF, Pitrat M, Marrakchi M, Lecoq H. Molecular, biological and serological variability of Zucchini yellow mosaic virus in Tunisia. Plant Pathol. 2008;57(6):1146-54
[7] Polischuk VP, Budzanivska IG, Shevchenko TP. Posibnyk praktychnyh zanyatt do kursu «Zagalna Virusologia». Kyiv: "Fotosociotsentr", 2005; 129-133.
[8] Antibodies. A practical approach. Ed Catty D. IRL Press, 1989; 280 p.
[9] Gnutova RV. Serologia i immunokhimia virusov rasteniy. M.: Nauka, 1993. 301 p.
[10] QIAGENR. One step RT-PCR Kit Handbook. Quiagen, 2002. 39p.
[11] Safaeizadeh M. Comparative biological and molecular variability of Zucchini yellow mosaic virus in Iran. Asian J Plant Pathol. 2008; 2(1):30-9.
[12] Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol Biol Evol. 2013;30(12):2725-9.