Biopolym. Cell. 2016; 32(2):131-139.
Віруси та клітина
Надзвичайна еволюційна стабільність консервативного некодуючого елементу (CNE) геному бакуловірусів
1Макаренко В. Е., 1Кіхно І. В., 1Кашуба В. І.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
Мета. Визначити рівень еволюційної стабільності CNE (conserved non protein-coding element) – некодуючого функціонального елементу бакуловірусного геному, що грає виключну роль у патогенезі бакуловірусів. Методи. Для ідентифікації ортологічних послідовностей в геномах 50 альфабакуловірусів застосовували NCBI-BLAST. Ортологічні послідовності вирівнювали за допомогою алгоритму вирівнювання ClustalW. Отримували матрицю значень відсотків ідентичності (percent identity, %ID) для попарних порівняннь за допомогою програми Alistat. Результати. Середній рівень ID (73 %), розрахований для 1225-членної вибірки, виявився порівнюваним з такими показниками кодуючих послідовностей найконсервативніших бакуловірусних генів polh та pif2, а також з показниками промоторних ділянок polh та p18, що є найконсервативнішими представниками невеликої групи еволюційно стабільних промоторних ділянок пізніх генів. Висновки. CNE є одним з найконсервативніших елементів геномів альфабакуловірусів.
Keywords: бакуловіруси, консервативний некодуючий елемент