Biopolym. Cell. 1987; 3(4):201-207.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0001F0
Структура та функції біополімерів
Вплив вибіркового зв’язування лігандів на молекулярне плавлення ДНК
1Фрідман А. С., 1Ландо Д. Ю.
  1. Інститут біоорганічної хімії АН Білоруської РСР
    Мінськ, СРСР

Abstract

Проведено теоретичний аналіз впливу непротяжних невзаємодіючих між собою при адсорбції лігандів з вибірковим характером зв’язування на перехід спіраль-клубок ДНК. Встановлено, що за безпосереднього зв’язування лігандів і у разі опосередкованого впливу розчинених речовин на теплову денатурацію ДНК має місце збіг характеристик процесу плавлення. Різниця спостерігається лише за великих температурних зсувів, обумовлених лігандами (більших за 40 °С), що пов’язано з нелінійністю залежності температури плавлення від GC-вмісту комплексу. Встановлено, що для ДНК з квазівипадковою і блоковою послідовностями пар основ ліганди обумовлюють однакові температурні зсуви, але різний характер залежності ширини температурного інтервалу переходу від концентрації.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Voskoboinik AD, Monaselidze DR, Mgeladze GN, Chanchalashvili ZI, Lazurkin IuS, Frank-kamenetskiĭ IM. Study of DNA melting in the region of the inversion of relative stability of AT and GC pairs. Mol Biol (Mosk). 1975;9(5):783-90.
[2] Akhrem AA, Lando DIu. Influence of ligands characteristic of selective binding to a certain type of base pairs on DNA helix-coil transition I. Model. Theory. Mol Biol (Mosk). 1979;13(5):1098-109.
[3] Akhrem AA, Lando DIu. Influence of ligands selective nature of the interaction at the helix - a tangle of DNA containing satellite fraction. Vestsi AN BSSR. Ser. Khim. 1981; (2):13-9.
[4] Akhrem AA, Lando DIu. Effect of selectively reacting ligands on the helix-coil transition of DNA. III. Calculation of the melting curves of DNA-ligand complexes. Mol Biol (Mosk). 1981;15(5):1083-92.
[5] Lando DIu, Kul'ba AM, Akhrem AA. Effect of selectively reacting ligands on the helix-coil transition of DNA. IV. Heat denaturation of DNA in an acid medium. Mol Biol (Mosk). 1981;15(5):1093-1101.
[6] Akhrem AA, Fridman AS, Lando DYu. Theory of helix-coil transition of the heterogeneous DNA-heteroqeneous ligands complexes. Biopolym Cell. 1985; 1(4):171-179
[7] Lyubchenko YL, Frank-Kamenetskii MD, Vologodskii AV, Lazurkin YS, Gause GG Jr. Fine structure of DNA melting curves. Biopolymers. 1976;15(6):1019-36.
[8] Tong BY, Battersby SJ. Melting fine structure of ϕX174 DNA and its fragments: A theroetical study. Biopolymers. 1978; 17(12):2933-7.
[9] Frank-Kamenetskii MD, Frank-Kamenetskii AD. Accounting for double-stranded in the theory of the helix - coil transition of DNA. Molekulyarnaya biologiya. 1969; 3(3):375-83.
[10] Fridman AS, Lando Diu. Cooperative contact interaction between the ligands adsorbed on DNA, causes a decrease in the width of the melting range. 5th all-union conf. on spectroscopy of biopolymers: Proc. of reports. Kharkov, 1984; 254.
[11] Belintsev BN, Vologodskii AV, Frank-Kamenetskii MD. Influence of base sequence on the stability of the double helix of DNA. Mol Biol (Mosk). 1976;10(4):629-33.