Biopolym. Cell. 2009; 25(1):50-55.
Віруси та клітина
Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1
1Пукіш Н. С., 2Щербінська А. М., 2Бабій Н. О., 1Поліщук В. П.
- Київський національний університет імені Тараса Шевченка
вул. Володимирська 64, Київ, Україна, 01601 - Український центр профілактики та боротьби зі СНІДом МОЗ України
вул. Миколи Амосова, 5, Київ, Україна, 03038
Abstract
Проведено аналіз геному ВІЛ-1 у ділянці гена pol 64 зразків крові ВІЛ-інфікованих осіб з використанням методу визначення нуклеотидної послідовності нуклеїнової кислоти. Встановлено, що домінуючим серед досліджених зразків ВІЛ-1 виявився субтип А, а значна кількість зразків належить до циркулюючих рекомбінантних форм ВІЛ-1. За результатами аналізу наявних мутацій знайдено лише одну, пов’язану з розвитком резистентності ВІЛ-1 до антиретровірусних препаратів. У більшості зразків визначено поліморфічні заміни нуклеотидів у досліджуваній ділянці геному ВІЛ-1.
Keywords: вірус імунодефіциту людини-1, поліморфічні заміни, мутації резистентності, рекомбінантні форми ВІЛ-1, субтип ВІЛ-1
Повний текст: (PDF, українською) (PDF, англійською)
References
[1]
Gallo R. C., MontagnierL. The discovery of HIV as the cause of AIDS New Engl. J. Med 2003 349, N 24:2283– 2285.
[2]
UNAIDS. AIDS Epidemic Update: December 2007.
[4]
Peters M., Sharp R. M. Genetic diversity of HIV-1: the moving target. AIDS. 2000; 14(3):129–140.
[5]
McCutchan F. E. Understanding the genetic diversity of HIV1. AIDS. 2000; 14(3):31–44.
[6]
Barlet J., Galant J. Clinical aspects of HIV-infection M.: EnRus, 2007 557 p.
[7]
de Ronde A., van Dooren M., van der Hoek L., Bouwhuis D., de Rooij E., van Gemen B., de Boer R., Goudsmit J. Esteblishment of new transmissible and drug sensitive human immunodeficiency virus type 1 wild types due to transmission of nucleoside analogue-resistant virus J. Virol 2001 75:595–602.
[9]
Vijver D., Wensing A., Boucher C. The epidemiology of transmission of drug resistant HIV-1. Sequence compendium 2006/2007 Los Alamos, 2007:17–36.
[10]
Tatt I., Barlow K., Nicoll A., Clewley J. The public health significance of HIV-1 subtypes. AIDS. 2001; 15, N 24 P. 59–71.
[11]
Saad M., Shcherbinskaya A., Nadai Y., Kruglov Y., Antonenko S., Lyullchuk M., Kravchenko O., Earhart K., Sanchez J., Birx D., Carr J. Molecular epidemiology of HIV type 1 in Ukraine: birthplace of an epidemic AIDS Res. and Hum. Retroviruses 2006 22, N 8:709–714.
[12]
Nabatov A., Kravchenko O., Lyulchuk M., Shcherbinskaya A., Lukashov V. Simultaneous introduction of HIV type 1 subtype A and B viruses into injecting drug users in southern Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet Union AIDS Res. and Hum. Retroviruses 2002 18, N 12:891–895.
[13]
Johnson V., Vezinet F., Clotet B., Gunthart H., Kuritzkes D., Pillay D., Shapiro J., Richman D. Update of drug resistance mutations in HIV-1: 2007 Top. HIV Med. 2007; 15(4):119–125.
[14]
Johnson V., Brun-Vezinet F., Cloet B., Gunthart H., Kuritzkes D., Pillay D., Shapiro J., Richman D. Update of Drug Resistance Mutations in HIV-1: 2006. Top. HIV Med. 2006; 14(3):125–130.
[15]
Shafer R., Rhee S., Pillay D., Miller V., Sandstrom P., Shapiro J., Kuritzkes D., Bennet D. HIV-1 protease and reverse transcriptase mutations for drug resistance surveillance AIDS 2007 21:215–223.
[16]
HIV drug resistance mutations by drug class (January 28, 2008) – http://hivdb.standford.edu
[17]
Sukasem C., Churdboonchart V., Sukeepaisarncharoen W., Piroj W., Inwisai T., Tiensuwan M., Chantratita W. Genotypic resistance profiles in antiretroviral-naVve HIV-1 infections before and after initiation of first-line HAART: impact of polymorphism on resistance to therapy Int. J. Antimicrob. Agents 2008 31, N 3:277–281.
[18]
Hu D., Subbarao S., Vanichseni S., Mock P., Ramos A., Nguyen L., Chaowanachan T., Griensven F., Choopanya K., Mastro T., Tappero J. Frequency of HIV-1 dual subtype infections, including intersubtype infections, among injection drug users in Bangkok, Thailand. AIDS. 2005;19(3):303-8.
