Biopolym. Cell. 2000; 16(2):145-152.
Методи
Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. 10. Синтез та спектральні властивості нових бензотіазоло-4- [2,6-диметилпіридинієвих] монометинових ціанінових барвників
1Криворотенко Д. В., 1Ковальська В. Б., 1Ярмолюк С. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

З метою розробки нових флюоресцентных ціанінових барвників для детещїі нуклеїнових кислот одержано ряд нових похідних 2,6-диметил-4-( 3-метші-ЗН-бензотіазол-2-іліденметил)-1 -алкіл-піридиній перхлорату. Досліджено спектрально-люмінесцентні властивості синтезованих барв­ників, їхніх комплексів з ДНК і РНК та в присутності білка. Вивчено вплив різноманітних функціональних груп у складі піридинієвих монометинових ціанінів на флюоресцентні властивості цих барвників та їхніх комплексів з нуклеїновими кислотами.

References

[1] Haughland RP. Molecular probes: Handbook of fluorescent probes and research chemicals. Molecular Probes. Eugene: OR Inc., 1996. 679 p.
[2] Rye HS, Yue S, Wemmer DE, Quesada MA, Haugland RP, Mathies RA, Glazer AN. Stable fluorescent complexes of double-stranded DNA with bis-intercalating asymmetric cyanine dyes: properties and applications. Nucleic Acids Res. 1992;20(11):2803-12.
[3] Rye HS, Quesada MA, Peck K, Mathies RA, Glazer AN. High-sensitivity two-color detection of double-stranded DNA with a confocal fluorescence gel scanner using ethidium homodimer and thiazole orange. Nucleic Acids Res. 1991;19(2):327-33.
[4] Rye HS, Dabora JM, Quesada MA, Mathies RA, Glazer AN. Fluorometric assay using dimeric dyes for double- and single-stranded DNA and RNA with picogram sensitivity. Anal Biochem. 1993;208(1):144-50.
[5] Kelemen J, Wizinger R. Uber alkylsulstituierte Pyrylo- and Pyridino-Cyanine I 2,6-Dimethylpyrylo- und 2,6-Dimethyl-pyridino-Ccyanine aus 2,6-Dimethyl-A-pyron. Helv Chim acta. 1962; 45(6): 1908-17.
[6] Yarmoluk SM, Kovalska VB, Kovtun YuP. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 5. Towards model of «half intercalation of monomethyne cyanine dyes into double-stranded nucleic acids. Biopolym Cell. 1999; 15(1):75-82.
[7] Velskiy IF, Dorofeenko GM, Prostakiv NS, Sherstyuk VP. The heterocycles in organic synthesis. Kiev: Tekhnika, 1970.
[8] Balaban AT, Toma C. Reactions of pyrylium salts with nucleophiles. IV. Isolation of an intermediate in the conversion of 2,4,6-triphenylpyrylium perchlorate into 2,4,6-triphenyl-pyridine by ammonia. Tetrahedron. 1966; 22(Suppl. 7): 1-8.
[9] Narkevich AN, Dorofeenko GN, Zhdanov YA. Condensation 2, 4, 6-tri-methyl-pyrylium perchlorate with amino acids and peptides. Dokl Akad Nauk SSSR. 1967; 176(1): 103-6.
[10] Zhdanov YuA, Dorofeenko GN, Narkevitch AN. Synthesis of natural compounds, their analogs and fragments. M.: Nauka, 1965. 160 p.
[11] Spielmann HP, Wemmer DE, Jacobsen JP. Solution structure of a DNA complex with the fluorescent bis-intercalator TOTO determined by NMR spectroscopy. Biochemistry. 1995;34(27):8542-53.