Застосування методу LOGIS для передбачення вторинної структури білка
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0004C9Анотація
У роботі для прогнозування вторинної структури білків запропоновано новий метод розпізнавання образів, відомий як метод LOGIS. Навчання та передбачення грунтуються на даних про вторинну структуру 108 білків (біля 20000 амінокислотних залишків) з рентгеноструктурним розділенням менше 0,2 нм. Середня точність передбачення складає 71 %.Посилання
Sternberg MJ, Islam SA. Local protein sequence similarity does not imply a structural relationship. Protein Eng. 1990;4(2):125-31.
Sergienko IV, Gupal AM, Bratus AV. LOG1S-system realizing statistical abductive conclusion on empirical data. Kibernetika. 1995;3: 160-73.
Kendall M, Stuart A. Multivariate statistical analysis and time series. M.: Nauka, 1976: 65-68.
Bratus AU, Maltchenko SZ, Chaschin NA. The proteins secondary structure prediction by the modified GUHA-method. Biopolym Cell. 1993; 9(5):61-6.
Rost B, Sander C. Combining evolutionary information and neural networks to predict protein secondary structure. Proteins. 1994;19(1):55-72.
