Конструювання ДНК-зонда з використанням солі срібла. 3. Дозова модифікація двохнитчатого зонда та добудова гібридів
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000445Анотація
Розглянуто варіанти отримання забарвленого зонда з використанням металокомплексу, який містить еталонаміно-формальдегідні ланцюжки, що утворюють координаційні зв'язки з іонами срібла. Модифікацію здійснювали на повністю денатурованій ДНК, частково розплетених за допомогою формальдегіду молекулах, а також дуплексах зонд – матриця за рахунок розгалуження уже сформованої структури олігомерних ланцюжків. Застосовуючи останній варіант забарвлення, при ступені денатурації = 10 % досягнута чутливість детектування іммобілізованої на нітроцелюлозних мембранах ДНК склала десятки пікограмів.Посилання
Lichina MV, Shugalii AV. The DNA probe construction with use the silver salt. 1. The formation and characterization of the oligomer coloured chains. Biopolym Cell. 1994; 10(2):38-44.
Lichina MV, Shugalii AV. The DNA probe construction with use the silver salt. 2. The colouring of the monomer and the single-stranded DNA. Biopolym Cell. 1994; 10(5):98-104.
Prima VI, Tarantul VZ, Shugali? AV, Gazarian KG. DNA reassociation: physical and biological aspects. Ukr Biokhim Zh. 1974;46(2):255-71.
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
Inman RB. Denaturation maps of the left and right sides of the lambda DNA molecule determined by electron microscopy. J Mol Biol. 1967;28(1):103-16.
Inman RB, Schn?s M. Partial denaturation of thymine- and 5-bromouracil-containing lambda DNA in alkali. J Mol Biol. 1970;49(1):93-8.
Shugalii AV, Manyakov VF, German AV. Electron microscopy of partially denatured DNA molecules. Mol Biol (Mosk). 1972; 6(6):902-7.
Badashkeeva AG, Zarytova VF. Biotinylated oligonucleotides as probes in the method of molecular hybridization. Mol Biol (Mosk). 1989;23(5):1221-6.
Lee AS, McGee JO. The signal intensity on Southern blots developed by nonisotopic methods is linear with time and quantity of DNA. Nucleic Acids Res. 1989;17(6):2364.
Chuchibabin LE. Basic Principles of Organic Chemistry. M.: GHI, 1963. vol. 1. 910 p.