Фізіологічне значення дезінтеграції структурових доменів ядерної ДНК: свідчення невипадкового розщеплення доменів ДНК
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0003FBАнотація
В роботі досліджували характер крупноблочної фрагментації у тканинах рослин з різним проліферативним статусом і ступенем диференціювання, а також у культурі лімфобластоїдних клітин людини у відсутності сироватки. Показано, що для тканин у стані спокою або диференційованих тканин характерно посилене формування великих фрагментів. При цьому разщеплені домени ядерної ДНК відрізняються від нерозщеплених за складом геномних послідовностей. Культивування лімфобластоїдних клітин у середовищі без сироватки супроводжується прогресивним зростанням крупноблочної фрагментації, яка швидко зменшується в залежності від додавання сироватки. Крім того, транзитне посилення крупноблрчної фрагментації викликає зміну локалізації послідовностей у розщеплених доменах. Отримані результати вказують на те, що модифікація нативності доменів ядерної ДНК, яка проявляється у різному характері крупноблочної фрагментації, може являти собою специфічну геномну реакцію, що супроводжується фізіологічними змінами, які відбуваються у клітинах, і мати відношення до перепрограмування геномної експресії.Посилання
Solov'ian VT, Andreev IO, Kunakh VA. Fractionation of eukaryotic DNA in a pulsed electrical field. II. Discrete DNA fragments and level of structural organization of chromatin. Mol Biol (Mosk). 1991;25(6):1483-91.
Filipski J, Leblanc J, Youdale T, Sikorska M, Walker PR. Periodicity of DNA folding in higher order chromatin structures. EMBO J. 1990;9(4):1319-27.
Razin SV, Petrov P, Hancock R. Precise localization of the alpha-globin gene cluster within one of the 20- to 300-kilobase DNA fragments released by cleavage of chicken chromosomal DNA at topoisomerase II sites in vivo: evidence that the fragments are DNA loops or domains. Proc Natl Acad Sci U S A. 1991;88(19):8515-9.
Cohen GM, Sun XM, Fearnhead H, MacFarlane M, Brown DG, Snowden RT, Dinsdale D. Formation of large molecular weight fragments of DNA is a key committed step of apoptosis in thymocytes. J Immunol. 1994;153(2):507-16.
Walker PR, Kokileva L, LeBlanc J, Sikorska M. Detection of the initial stages of DNA fragmentation in apoptosis. Biotechniques. 1993;15(6):1032-40.
Oberhammer F, Wilson JW, Dive C, Morris ID, Hickman JA, Wakeling AE, Walker PR, Sikorska M. Apoptotic death in epithelial cells: cleavage of DNA to 300 and/or 50 kb fragments prior to or in the absence of internucleosomal fragmentation. EMBO J. 1993;12(9):3679-84.
Brown DG, Sun XM, Cohen GM. Dexamethasone-induced apoptosis involves cleavage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J Biol Chem. 1993;268(5):3037-9.
Collins SJ. The HL-60 promyelocytic leukemia cell line: proliferation, differentiation, and cellular oncogene expression. Blood. 1987;70(5):1233-44.
Osheroff N. Biochemical basis for the interactions of type I and type II topoisomerases with DNA. Pharmacol Ther. 1989;41(1-2):223-41.
Liu LF. DNA topoisomerase poisons as antitumor drugs. Annu Rev Biochem. 1989;58:351-75.
Smith HC, Berezney R. Nuclear matrix-bound deoxyribonucleic acid synthesis: an in vitro system. Biochemistry. 1982;21(26):6751-61.
Heller C, Pohl FM. A systematic study of field inversion gel electrophoresis. Nucleic Acids Res. 1989;17(15):5989-6003.
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 344-50.
Solovyan VT, Andreyev IO, Kunakh VA. The functional organization of plant nuclear DNA. I. Evidence for nuclear topoisomerase II. DNA complex. Mol Biol (Mosk). 1993; 27(6):1245-51.
