Матрична специфічність i екзонуклеазні активности ДНК-полімерази ціанобактерій Plectonema boryanum
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000395Анотація
Досліжено функціональні характеристики ДНК-залежних ДНК-полімераз, ціанобактерії P. boryanum. Встановлено, що ДНК-полімераза II (ДПП) активно використовує матриці з різною структурою (найбільш активний фермент на ДНК P. boryanum та ціанофага LPP-З, який лізує цю ціанобактерію), ДНК-полімераза I (ДПІ) менш активна на більшості випробуваних матриць, за винятком ціанобактеріальної ДНК. Обидва ферменти потребують праймування синтетичних рибонуклешових матриць та проявили різну здатніть до включения кожного з дезоксинуклеозидтрифосфатів. ДПІ та ДПІІ мають 3'–5'-екзонуклеазну активність, при цьому ДПІІ має потужнішу асоційовану екзонуклеазу. Тільки ДПІ здатна гiдpoлiзyвaти фocфoдieфipнi зв'язки у 5'–3'-напрямку. Зроблено висновок про можливу функцюнальну роль ціанобактеріальних ДHK-пoлiмepaз in vivo: ДПП е основним клітинним реплікативним ферментом, а ДПІ відповідає за здiйcнeння репаративних процессів та близька за функціями до ДНК-полімерази I Escherichia coli.Посилання
Lysenko TG, Shainskaya OA, Gerashchenko IV, Syrchin SA. Comparison of two methods for obtaining cell-free extracts of cyanobacteria for studying the activity of dehydrogenases. Mikrobiol Zh. 1989; 51(3):87-91.
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
Mendzhul MI, Nesterova NV, Sukhanov SN. Extraction and partial purification of DNA-dependent DNA-polymerase from cells of cyanobacterium Plectonema boryanum. Mikrobiol Zh. 1993; 55(2):46-51.
Mendzhul MI, Syrchin SA, Averkiev AA, Busakhina IV. Comparison of different methods of cyanophage LPP-3 isolation and its DNA. Mikrobiol Zh. 1992; 54(2):70-4.
Mendzhul MI, Syrchin SA, Averkiev AA, Rebentish BA. The way of defence of cyanophage LPP-3 DNA against restriction-modification systems in the cells cyanobacterium Plectonema boryanum. Biopolym Cell. 1993; 9(5):54-61.
Methods of molecular genetics and genetic engineering. Ed. RI Salganik. Novosibirsk: Nauka, 1990: 28 p.
Sukhanov SN, Nesterova NV, Mendzhul MI. Physicochemical properties and sensitivity to inhibitors of cyanobacterium Plectonema boryanym DNA-polymerases. Mikrobiol Zh. 1993; 55(5):42-50.
Bollum FJ. Filter paper disk techniques for assaying radioactive macromolecules. Methods Enzymol. 1968;169–73.
H?bscher U. DNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes: mode of action and biological implications. Experientia. 1983;39(1):1-25.
Klenow H, Henningsen I. Selective elimination of the exonuclease activity of the deoxyribonucleic acid polymerase from Escherichia coli B by limited proteolysis. Proc Natl Acad Sci U S A. 1970;65(1):168-75.
Holler E, Fischer H, Simek H. Non-disruptive detection of DNA polymerases in nondenaturing polyacrylamide gels. Eur J Biochem. 1985;151(2):311-7.
Nossal NG. Prokaryotic DNA replication systems. Annu Rev Biochem. 1983;52:581-615.
Porter RD. DNA transformation. Methods Enzymol. 1988;167:703-12.
