Вивчення конформаційних характеристик транскрипційно активного та репресованого хроматину за допомогою флюоресцентных зондів
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.00038FАнотація
За допомогою флюоресцентних зондів пірена i 1,8-АНС вивчено конформаційні характеристики фракцій активного та репресованого хроматину iз печінки щурів. Показано, що між хромофорами білків хроматину i введеними до розчину молекулами пірена спостерігається індуктивно-резонансний перенос енергії (ІРПЕ), який дає уявлення про деякі структурні параметри білок-лідної взаємодії. Розраховано імовірність переносу енергії з білкових флюорофорів на пірен та частку триптофанових залишків білків, що беруть участь у ІРПЕ. Помітні розбіжності у значениях згаданих параметрів для розглянутих фракщй хроматину дозволили зробити висновок про більш пухке укладання активної фракції, що є необхідною передумовою для запуску i здійснення процесу транскрипції, а також про залежність його відхарактеру взаемодії білків i ліпідів у хроматині.Посилання
Vladimirov YuA., Dobretsov GE. Fluorescent Probes in the study of biological membranes. Moscow: Nauka, 1980. 320 p.
Dobretsov GE. Fluorescent probes in the study of cell membranes and lipoproteins. Moscow: Nauka, 1989. 277 p.
J. Lakovich, Principles of Fluorescence Spectroscopy. Plenum, New York, 1986.
Chikhirzhina GI, Domkina LK, Chigareva NG, Ashmarin IP. Solubilization of chromatin by an endogenous enzymic Ca2+, Mg2+-dependent factor. Activity of residual chromatin. Mol Biol (Mosk). 1976;10(6):1303-10.
Tsanev RG, Markov GG. On the problem of quantitative spectrophotometric determination of nucleic acid. Biokhimiia. 1960;25:151-9.
Gubskiĭ IuI, Levitskii EL, Gol'dshteĭn NB, Mozzhukhina TG, Litoshenko AIa, Novikova SN. Functional activity of fractionated chromatin from rat liver upon a single administration of carbon tetrachloride. Vopr Med Khim. 1989;35(4):119-24.
Gubskiĭ IuI, Levitskii EL, Primak RG, Golubov MI, Novikova SN. Conformational characteristics and packing of endogenous lipid fractions of transcriptionally active and repressed chromatin. Ukr Biokhim Zh. 1991;63(2):83-9.
Gubskiĭ IuI, Levitskiĭ EL, Chabannyĭ VN, Gol'dshteĭn NB, Kapralov AA, Petrova GV, Donchenko GV, Volkov GL, Litoshenko AIa. Changes in protein, lipid composition, DNA- and RNA- polymerase activity of the chromatin fraction and the nuclear matrix of the rat liver in hypovitaminosis E. Ukr Biokhim Zh. 1990;62(6):22-30.
Kraevskii VA, Krylov DIu, Razin SV, Mikhailov VS. Analysis of the conformational mobility of DNA in transcriptionally-active chromatin. Biofizika. 1993;38(1):108-16.
Dobretsov GE. Fluorescent probe study of the spatial structure of membranes and lipoproteins. Ukr Biokhim Zh. 1984;56(2):211-22.
Demchenko AP. Luminescence and protein structure dynamics . Kiev Naukova. Dumka, 1988. 280 p.
Vekshin NL. Use of pyrene as a luminescence indicator of the viscosity of model and biological membranes. Nauchnye Doki Vyss Shkoly Biol Nauki. 1987;(11):59-66.
Levitsky E. L., Gubsky Yu. I., Chabanny V. N., Volkov G. L., Novikova S. N. Biochemical characteristics of the rat liver transcriptionally active and repressed chromatin. Biopolym Cell. 1993; 9(6):13-21.
