Фракціонування ДНК еукаріот в пульсуючому електричному полі. особливості поведінки ДНК-топоізомеразного комплексу в препаратах ізольованих ядер
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000381Анотація
Досліджено властивості ДНК-топоізомеразного комплексу в препаратах ізольованих ядер. Показано, що комплекс ядерна ДНК – топоізомераза II функціонує однаково як у середовищі з Mg2+, так і з Ca2+. На відміну від комплексу за умов in vitro, ядерний ДНК-топоізомеразний комплекс, оброблений ЕДТА, сприяє не лігуванню, а підсиленню розщеплення ядерної ДНК. Залежне від ЕДТА посилене розщеплення ДНК спостерігається, коли ядра, інкубовані у середовищі з Mg2+ (Ca 2+ ) , були оброблені ЕДТА або за інкубації MgE (CaE)ядер у присутності іонів Mg2+. Показано, що ядерний комплекс, оброблений Ds-Na, набуває властивості Ds-Na-незалежного розщеплення ядерної ДНК. Особливості поведінки комплексу топоізомераза II – ядерна ДНК можуть бути пов'язані з участю фермента у підтримці вищих рівнів структурової організації хроматину, що призводить до модифікації комплексу за умов in vivo. Зроблено припущення про наявність в клітинах різних варіантів ДНК-топоізомеразного комплексу, що може мати фізіологічне значення.Посилання
Solovyan VT, Andreyev IO, Kunakh VA. The fractionation of eukaryotic dna by pulsed field gel electrophoresis. Evidence for nuclear DNA organization as constituent component of topoisomerase II/DNA complex. Biopolym Cell. 1993; 9(5):44-51.
Solovĭan VT, Kunakh VA. Fractionation of eukaryotic DNA in a pulsating electrical field. I. Detection and properties of discrete DNA fragments. Mol Biol (Mosk). 1991;25(4):1071-9.
Solov'ian VT, Andreev IO, Kunakh VA. Fractionation of eukaryotic DNA in a pulsed electrical field. II. Discrete DNA fragments and level of structural organization of chromatin. Mol Biol (Mosk). 1991;25(6):1483-91.
Sander M, Hsieh T. Double strand DNA cleavage by type II DNA topoisomerase from Drosophila melanogaster. J Biol Chem. 1983;258(13):8421-8.
Liu LF, Rowe TC, Yang L, Tewey KM, Chen GL. Cleavage of DNA by mammalian DNA topoisomerase II. J Biol Chem. 1983;258(24):15365-70.
Osheroff N, Zechiedrich EL. Calcium-promoted DNA cleavage by eukaryotic topoisomerase II: trapping the covalent enzyme-DNA complex in an active form. Biochemistry. 1987;26(14):4303-9.
Osheroff N. Effect of antineoplastic agents on the DNA cleavage/religation reaction of eukaryotic topoisomerase II: inhibition of DNA religation by etoposide. Biochemistry. 1989;28(15):6157-60.
Earnshaw WC, Heck MM. Localization of topoisomerase II in mitotic chromosomes. J Cell Biol. 1985;100(5):1716-25.
Gasser SM, Laemmli UK. The organisation of chromatin loops: characterization of a scaffold attachment site. EMBO J. 1986;5(3):511-8.
Berrios M, Osheroff N, Fisher PA. In situ localization of DNA topoisomerase II, a major polypeptide component of the Drosophila nuclear matrix fraction. Proc Natl Acad Sci U S A. 1985;82(12):4142-6.
Cockerill PN, Garrard WT. Chromosomal loop anchorage of the kappa immunoglobulin gene occurs next to the enhancer in a region containing topoisomerase II sites. Cell. 1986;44(2):273-82.
Earnshaw WC, Halligan B, Cooke CA, Heck MM, Liu LF. Topoisomerase II is a structural component of mitotic chromosome scaffolds. J Cell Biol. 1985;100(5):1706-15.
Uemura T, Ohkura H, Adachi Y, Morino K, Shiozaki K, Yanagida M. DNA topoisomerase II is required for condensation and separation of mitotic chromosomes in S. pombe. Cell. 1987;50(6):917-25.
Newport J. Nuclear reconstitution in vitro: stages of assembly around protein-free DNA. Cell. 1987;48(2):205-17.
Sperry AO, Blasquez VC, Garrard WT. Dysfunction of chromosomal loop attachment sites: illegitimate recombination linked to matrix association regions and topoisomerase II. Proc Natl Acad Sci U S A. 1989;86(14):5497-501.
Adachi Y, Käs E, Laemmli UK. Preferential, cooperative binding of DNA topoisomerase II to scaffold-associated regions. EMBO J. 1989;8(13):3997-4006.
