Особливості будови контактної зони тромбіну. Можливі механізми його взаємодії з низько- та високомолекулярними субстратами
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000336Анотація
Показано особливості побудови активного центру тромбіну та його вторинної контактної ділянки. Розглянуто альтернативні механізми взаємодії тромбіну з низького високомолекулярними субстратами, а також можливу роль так званого додаткового центру в утворенні продуктивного фермент-субстратного комплексу.Посилання
Sonder SA, Fenton JW 2nd. Proflavin binding within the fibrinopeptide groove adjacent to the catalytic site of human alpha-thrombin. Biochemistry. 1984;23(8):1818-23.
Berliner LJ, Bauer RS, Chang TL, Fenton JW 2nd, Shen YY. Active-site topography of human coagulant (alpha) and noncoagulant (beta) thrombins. Biochemistry. 1981;20(7):1831-7.
Kibirev VK, Romanova VP, Serebrianyĭ SB. Structural bases of thrombin specificity. Role of secondary interactions. Biokhimiia. 1983;48(6):937-43.
Bode W, Mayr I, Baumann U, Huber R, Stone SR, Hofsteenge J. The refined 1.9 A crystal structure of human alpha-thrombin: interaction with D-Phe-Pro-Arg chloromethylketone and significance of the Tyr-Pro-Pro-Trp insertion segment. EMBO J. 1989;8(11):3467-75.
Blombäck B. Specificity of thrombin and its action on fibrinogen. Ann N Y Acad Sci. 1986;485:120-3.
Sereyskaya AA, Smirnova IV. Action of clotting (α) and nonclotting (α) thrombins on bovine fibrinogen N-terminal fragments. Biopolym Cell. 1991; 7(3):82-9.
Sereiskaya AA, Karabut LV, Smirnova IV, Shchechkin IE. Interaction of additional center of thrombin with a complementary site of fibrinogene. Doklady Akad Nauk Ukr SSR. 1991; (11):140-3.
Fenton JW 2nd. Regulation of thrombin generation and functions. Semin Thromb Hemost. 1988;14(3):234-40. Review.