Виявлення pUC19-гомологічних повторюваних послідовностей у геномі деяких видів вищих рослин
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000320Анотація
За допомогою методу блот-гібридизації за Саузерном у складі ядерної ДНК кількох видів вищих рослин (Secale сегеаіе, Zea mays, Triticum aestivum, Solanum nigrum, S. tuberosum, Atropa belladonna, Licopersicon esculentum) виявлено послідовності, що повторюються, гомологічні ДНК плазміди pUC19. У Складі геномної ДНК жита і красавки вони розміщені у вигляді кластерів. Встановлено розбіжності у числі та організації puC-повторів в геномах різних видів і окремих ліній (поколінь – у жита) одного виду. Показано можливість використання pUC-повторів як маркерів при соматичній гібридизації беладонни та тютюну. Обговорюється можливий зв'язок виявлених фактів з нестабільністю генома рослин.Посилання
Il'in IuV. Repeated genes in eukaryotes. Mol Biol (Mosk). 1982;16(2):229-57.
Koukalová B, Reich J, Matyášek R, Kuhrová V, Bezděk M. A BamHI family of highly repeated DNA sequences of Nicotiana tabacum. Theor Appl Genet. 1989;78(1):77-80.
Ganal MW, Lapitan NLV, Tanksley SD. A molecular and cytogenetic survey of major repeated DNA sequences in tomato (Lycopersicon esculentum). Mol Gen Genet. 1988;213(2-3):262–8.
Zamir D, Tanksley SD. Tomato genome is comprised largely of fast-evolving, low copy-number sequences. Mol Gen Genet. 1988;213(2-3):254–61.
Simoens CR, Gielen J, Van Montagu M, Inzé D. Characterization of highly repetitive sequences of Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res. 1988;16(14B):6753-66.
Jones JDG, Flavell RB. The mapping of highly-repeated DNA families and their relationship to C-bands in chromosomes of Secale cereale. Chromosoma. 1982;86(5):595–612.
Appels R, Moran LB, Gustavson JP. The structure of DNA from the rye (Secale cereale) NORRI locus and its behavior in wheat backgrounds. Can J Genet Cytol. 1986; 28(2): 673-85.
Ranade SA, Lagu MD, Patankar SM, Dabak MM, Dhar MS, Gupta VS, Ranjekar PK. Identification of a dispersed MboI repeat family in five higher plant genomes. Biosci Rep. 1988;8(5):435-41.
Deumling B. Sequence arrangement of a highly methylated satellite DNA of a plant, Scilla: A tandemly repeated inverted repeat. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78(1):338-42.
Kato A, Yakura K, Tanifuji S. Sequence analysis of Vicia faba repeated DNA, the FokI repeat element. Nucleic Acids Res. 1984;12(16):6415-26.
Zimmerman PA, Lang-Unnasch N, Cullis CA. Polymorphic regions in plant genomes detected by an M13 probe. Genome. 1989;32(5):824–8.
Zubko MK, Zubko EI, Kapranov PhV. Induction of chlorophyll deficient tobacco mutants as markers for cell engineering. Biopolym Cell. 1991;7(4):72-9.
Vlasák J. Effect of different disintegration techniques and media on yield and appearance of isolated nuclei. Biol Plan. 1981;23(6):406–13.
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
Westneat DF, Noon WA, Reeve HK, Aquadro CF. Improved hybridization conditions for DNA 'fingerprints' probed with M13. Nucleic Acids Res. 1988;16(9):4161.
