Взаємодія акридину з одноланцюговими полінуклеотидами за даними лазерної поляризованої флуоресценції
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000312Анотація
Методом лазерної поляризованої флюоресценції вивчено взаємодію акридинового забарвника акрихіну з однонитковими полінуклеотидами полі (А) та полі (U) у водних розчинах з нейтральним значенням рН. При малих співвідношеннях молярних концентрацій полімеру і забарвника (P/D) та низькій іонній силі домінує агрегація молекул акрихіну, що виникає в результаті кооперативного зв'язування з поліаніонною матрицею із стекінгом хромофорів. Агрегація характеризується гіпохромізмом спектрів поглинання і майже повним гасінням флюоресценції. При високих значеннях P/D купки молекул забарвника розпадаються і їх хромофори переключаються на стекінг з кільцями основ із зміною оптичних властивостей, характерною для інтеркаляції у подвійну спіраль ДНК. На основі одержаних даних за допомогою теорій Шварца та Нсчипурепка проведено кількісний аналіз конкуренції двох типів комплексоутворення.Посилання
Lober G, Kleinwachter V, Koudelka J et al. Molecular and spectroscopic aspects of chromosome binding. Biol Zbl. 1976;1-95(2):169-91.
Wilson WD, Lopp IG. Analysis of cooperativity and ion effects in the interaction of quinacrine with DNA. Biopolymers. 1979;18(12):3025-41.
Strauss UP, Smith EH, Wineman PL. Polyphosphates as Polyelectrolytes. I. Light Scattering and Viscosity of Sodium Polyphosphates in Electrolyte Solutions 1 . J Am Chem Soc. 1953;75(16):3935–40.
Govor II, Nesterenok VM. Power stabilizer CER. Pribory i tekhnika eksperimenta. 1974; 3:168-9.
Löber G, Koudelka J, Smékal E+SMEKAL E. Stacking interactions of ethidium bromide bound to a polyphosphate and phage DNA in situ. Biophys Chem. 1974;2(2):158-63.
Balcarová Z, Kleinwächter V, Koudelka J, Klarner R, Löber G. Interaction of phenosafranine with nucleic acids and model polyphosphates. I. Self-aggregation and complex formation with inorganic polyphosphates. Biophys Chem. 1978;8(1):17-25.
Lober G. The fluorescence of dye-nucleic acid complexes. J Lumin. 1981;22(3):221–65.
Saenger W. Principles of nucleic acid structure. New York: Springer, 1984; 556 p.
Baldini G, Doglia S, Sassi G, Lucchini G. Fluorescence analysis of G·C versus A·T binding of quinacrine to DNA. Int J Biol Macromol. 1981;3(4):248–52.
Schwarz G. Cooperative binding to linear biopolymers. 1. Fundamental static and dynamic properties. Eur J Biochem. 1970;12(3):442-53.
Nechipurenko IuD. Cooperation effects in binding of large ligands to DNA. II. Contact interactions between adsorbed ligands. Mol Biol (Mosk). 1984;18(4):1066-80.
