Вплив термінальної модифікації олігонуклеотидів на їхню стабільність у клітинах мікоплазм
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0002F0Анотація
Досліджено вплив модифікації 5'- і З'-кінцевих ланок дезоксирибонуклеотидів на їх стабільність в культуральному середовищі та клітинах мікоплазм Acholeplasma Iaidlawii PG-8 і Mycoplasma capricolum California Kid. Показано, що в середовищі з 10 % сироватки коня всі похідні стабільні на протязі 24 год. В середовищі з мікоплазмами, а також всередині клітин всі незахищені з 5'-кінця олігонуклеотиди швидко руйнуються до мононуклеотидів і дефосфорилюються. В клітинах утворений фосфат реутилізується. Феназінієва або холестеринова групи на З'-кінці олігонуклеотидів перешкоджають його руйнуванню. Похідні від гетерогенних олігонуклеотидів руйнуються швидше, ніж оліготиміділати. Модифікація олігонуклеотидів по 5'-кінцю шляхом утворення 5'-фосфамідів перешкоджає їх дефосфорилюванню та уповільнює деградацію олігонуклеотидів. Останні, захищені з 3'- та 5'-кінців, є найбільш стабільними по відношенню до дії нуклеаз мікоплазм.Посилання
Knorre DG, Vlassov VV, Zarytova VF, Lebedev AV. Reactive oligonucleotide derivatives as tools for site specific modification of biopolymers. Sov. Sci. Rev. 1989; 12(5):271-339.
Letsinger RL, Zhang GR, Sun DK, Ikeuchi T, Sarin PS. Cholesteryl-conjugated oligonucleotides: synthesis, properties, and activity as inhibitors of replication of human immunodeficiency virus in cell culture. Proc Natl Acad Sci U S A. 1989;86(17):6553-6.
Uhlmann E, Peyman A. Antisense oligonucleotides: a new therapeutic principle. Chem Rev. 1990;90(4):543–84.
Stanbridge EJ, Reff ME. The mycoplasmas. Eds M. F. Barile, S. Razin. New York: Acad, press, 1979. Vol. I: 157-85.
Lo SC, Dawson MS, Wong DM, Newton PB 3rd, Sonoda MA, Engler WF, Wang RY, Shih JW, Alter HJ, Wear DJ. Identification of Mycoplasma incognitus infection in patients with AIDS: an immunohistochemical, in situ hybridization and ultrastructural study. Am J Trop Med Hyg. 1989;41(5):601-16.
Chowdhury IH, Munakata T, Koyanagi Y, Kobayashi S, Arai S, Yamamoto N. Mycoplasma can enhance HIV replication in vitro: a possible cofactor responsible for the progression of AIDS. Biochem Biophys Res Commun. 1990;170(3):1365-70.
Zarytova VF, Ivanova EM, Romanenko VP. Synthesis of oligonucleotides by phosphotriester approach in chloroform. Bioorg Khim. 1983; 9(4):516-21.
Zarytova VF, Ivanova EM, Chasovskikh MN. Synthesis of steroid-containing oligonucleotides and their alkylating derivatives. Bioorg Khim. 1990;16(5):610-6.
Zarytova VF, Ivanova EM, Kutyavin IV synthesis derivatives of oligodeoxyribonucleotides containing at the 3'-end of the chain residue N-(2-hydroxyethyl)-phenazinium Izvestia SO AN USSR. khim seria 1989;(6):3—9.
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
Godovikova TS, Zarytova VF, Mal'tseva TV, Khalimskaia LM. Active derivatives of oligonucleotides with a zwitterionic terminal phosphate group for design of affinity reagents and probes. Bioorg Khim. 1989;15(9):1246-52.
Grineva NI, Lomakina TS, Tegeyeva NG, Chimitova TA. Kinetics of the C–Cl bond ionization in the nucleoside and oligonucleotide 4-(N-2-chloroethyl-N-methylamino)benzyl 5'-phosphamides. Bioorg Khim. 1977; 3(2):210-214
