Комп’ютерний пошук в Alu-повторах промотороподібних послідовностях для РНК-полімерази ІІ і потенційних пептидів Alu
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0002AFАнотація
У першому мономері Alu-повторів комп'ютерним аналізом виявлені CAAT- і TATA- блоки, які характерні промоторам еукаріотичиих генів, що транскрибуються РНК-полімеразою II. У другому мономері Alu-повторів знайдені відкриті рамки зчитування, які кодують короткі пептиди. Два мажорних класи цих пептидів складають біля 75 % усіх потенціальних пептидів Alu, їх названо відповідно EAE- та GG-потенційнимн пептидами.Посилання
Lewin B. Genes. (2nd Edition). New York, John Wiley & Sons, 1985; 734 p.
Shakhmuradov IA, Kolchanov NA, Omel'ianchuk LV. et al. Evolution of Alu repeats. Novosibirsk, 1987. 55. (Preprint. USSR Academy of Sciences, Institute of Cytology and Genetics).
Korneev SA. Repetitive sequences of the human genome. Genetika. 1988;24(6):965-79.
Elder JT, Pan J, Duncan CH, Weissman SM. Transcriptional analysis of interspersed repetitive polymerase III transcription units in human DNA. Nucleic Acids Res. 1981;9(5):1171-89.
Limborska SA, Korneev SA, Maleeva NE, Slominsky PA, Jincharadze AG, Ivanov PL, Ryskov AP. Cloning of Alu-containing cDNAs from human fibroblasts and identification of small Alu+ poly(A)+ RNAs in a variety of human normal and tumor cells. FEBS Lett. 1987;212(2):208-12.
Solov'yev VV, Kel' AE, Rogozin IV, Kolchanov NA. Introduction to the theory of genetic texts. Novosibirsk, Izd-vo Novosib. un-ta, 1987; 92 p.
Berdichevskiĭ FB, Chumakov IM, Kiselev LL. Decoding of the primary structure of the son3 region in human genome: identification of a new protein with unusual structure and homology with DNA-binding proteins. Mol Biol (Mosk). 1988;22(3):794-801.
Fütterer J, Gordon K, Bonneville JM, Sanfaçon H, Pisan B, Penswick J, Hohn T. The leading sequence of caulimovirus large RNA can be folded into a large stem-loop structure. Nucleic Acids Res. 1988;16(17):8377-90.
Allison LA, Moyle M, Shales M, Ingles CJ. Extensive homology among the largest subunits of eukaryotic and prokaryotic RNA polymerases. Cell. 1985;42(2):599-610.
