Пошук гігантських ДНК-білкових комплексів за допомогою ЕОМ
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0002A0Анотація
Створено дві програми для виявлення та візуалізації просторової асиметрії ДНК. З їхньою допомогою проаналізовано 2 мкм плазміду дріжджів-сахароміцетів. Виявлено ділянку особливої орієнтації G–С-пар. Розташування цієї ділянки збігається з локалізацією ненуклеосомного ДНК-білкового комплексу, виявленого раніше в експериментальній роботі. Створені програми можуть бути використані для пошуку великих ДНК-білкових комплексів.Посилання
Johnson PF, McKnight SL. Eukaryotic Transcriptional Regulatory Proteins. Annu Rev Biochem. 1989;58(1):799–839.
Saenger W. Principles of nucleic acid structure. New York: Springer, 1984; 556 p.
Goulet I, Zivanovic Y, Prunell A. Helical repeat of DNA in solution. The V curve method. Nucleic Acids Res. 1987;15(7):2803-21.
Satchwell SC, Drew HR, Travers AA. Sequence periodicities in chicken nucleosome core DNA. J Mol Biol. 1986;191(4):659-75.
Hartley JL, Donelson JE. Nucleotide sequence of the yeast plasmid. Nature. 1980;286(5776):860-5.
Soĭdla TR, Nevzgliadova OV. A 2-um plasmid of Saccharomyces. Mol Biol (Mosk). 1987;21(6):1467-79.
Murray JA, Cesareni G. Functional analysis of the yeast plasmid partition locus STB. EMBO J. 1986;5(12):3391-9.
Fagrelius TJ, Livingston DM. Location of DNAase I sensitive cleavage sites in the yeast 2 micron plasmid DNA chromosome. J Mol Biol. 1984;173(1):1-13.
Veit BE, Fangman WL. Chromatin organization of the Saccharomyces cerevisiae 2 microns plasmid depends on plasmid-encoded products. Mol Cell Biol. 1985;5(9):2190-6.
Ptashne M. Gene regulation by proteins acting nearby and at a distance. Nature. 1986 Aug 21-27;322(6081):697-701.
