Нуклеотидна послідовність великого повтору 5S ДНК у диплоїдної пшениці Triticum monococcum L.
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0000D4Анотація
Визначено нуклеотидну послідовність великої повторюваної одиниці 5S ДНК у диплоїдної пшениці Т. monococcum протяжністю 485 п. н. Показано, що відмінності у розмірах двох родин повторів 5S ДНК у даного виду пшениці пов’язані з делецією 154 п. н. у центральній області міжгенного спейсера. Виявлено високу гомологію областей, що кодують 5S рРНК, термінуючих послідовностей, 3'-кінців міжгенних спейсерів в обох родинах повторів 5S ДНК, а також між повторами однакової протяжності у двох зразків Т. monococcum. Встановлено, що на відміну від дводольних рослин у вивчених видів злаків послідовність ATATATATTA локалізована ближче до 5'-кінця міжгенного спейсера.Посилання
Vakhitov VA, Nikonorov IuM. Primary structure of the 5S rRNA gene with shortened non-transcribed spacer in diploid wheat Triticum monococcum L. Mol Biol (Mosk). 1988;22(2):406-13.
Vakhitov VA, Gimalov FR, Shumiatskii GP. Nucleotide sequences of 5S rRNA genes of polyploid species of wheat and Aegilops species. Mol Biol (Mosk). 1989;23(2):431-40.
Mackay RM, Spencer DF, Doolittle WF, Gray MW. Nucleotide sequences of wheat-embryo cytosol 5-S and 5.8-S ribosomal ribonucleic acids. Eur J Biochem. 1980;112(3):561-76.
Vakhitov VA, Gimalov FR, Nikonorov IuM. Determination of the copy number of genes for 5S rRNA and tRNA in genomes of 43 species of wheat and Aegilops. Genetika. 1986; 22(4):676-83.
Gerlach WL, Dyer TA. Sequence organization of the repeating units in the nucleus of wheat which contain 5S rRNA genes. Nucleic Acids Res. 1980;8(21):4851-65.
Nosikov VV, Braga EA. Ribosomal RNA genes. Itogi nauki i tekhniki. Moscow, VINITI, 1982;(Ser. Biol. Khimiya; Vol. 18) 110-215
Mazin AL, Vaniushin BF. The loss of CpG dinucleotides from DNA. I. Methylated and non-methylated genome compartments in eukaryotes with different levels of 5-methylcytosine in DNA. Mol Biol (Mosk). 1987;21(2):543-51.
Mazin AL, Vaniushin BF. The loss of CpC dinucleotides from DNA. II. Methylated and non-methylated genes of vertebrates. Mol Biol (Mosk). 1987;21(2):552-62.
Pieler T, Oei SL, Hamm J, Engelke U, Erdmann VA. Functional domains of the Xenopus laevis 5S gene promoter. EMBO J. 1985;4(13B):3751-6.
Morton DG, Sprague KU. In vitro transcription of a silkworm 5S RNA gene requires an upstream signal. Proc Natl Acad Sci U S A. 1984;81(17):5519-22.
Hemleben V, Werts D. Sequence organization and putative regulatory elements in the 5S rRNA genes of two higher plants (Vigna radiata and Matthiola incana). Gene. 1988;62(1):165-9.
Rafalski JA, Wiewiorowski M, Soll D. Organization and nucleotide sequence of nuclear 5S rRNA genes in yellow lupin (Lupinus luteus). Nucleic Acids Res. 1982;10(23):7635-42.
Hariharan N, Reddy PS, Padayatty JD. 5S-rRNA genes in rice embryos. Plant Mol Biol. 1987;9(5):443-51.
Lawrence GJ, Appels R. Mapping the nucleolus organizer region, seed protein loci and isozyme loci on chromosome 1R in rye. Theor Appl Genet. 1986;71(5):742-9.