Зустрічальність гомопурин-гомопіримідинових дзеркальних повторів у природних ДНК

Автор(и)

  • Г. М. Субоч Інститут молекулярної генетики АН СРСР Москва, СРСР Автор
  • Ю. А. Сприжицький Інститут молекулярної генетики АН СРСР Москва, СРСР Автор
  • А. А. Александров Інститут молекулярної генетики АН СРСР Москва, СРСР Автор

DOI:

https://doi.org/10.7124/bc.0000CF

Анотація

Проведено детальний аналіз зустрічальності потенційних сайтів утворення H-форми (Н-паліндромів) та інших локальних гомопурин-гомопіримідинових дзеркальних повторів у різних функціональних областях природних ДНК. Отримано розподіли зустрічальності таких поєднань нуклеотидів щодо точок ініціації і термінації трансляції.

Посилання

Lazurkin YuS. DNA: supercoiling and alternative structures. Biopolym Cell. 1986; 2(6):283-92.

Lyamichev VI, Mirkin SM, Frank-Kamenetskii MD. A PH-dePendent structural transition in the homoPurine-homoPyrimidine tract in suPerhelical DNA. Biopolym Cell. 1986; 2(3):115-24.

Lyamichev VI, Mirkin SM, Frank-Kamenetskii MD. Structures of homopurine-homopyrimidine tract in superhelical DNA. J Biomol Struct Dyn. 1986;3(4):667-9.

Mirkin SM, Lyamichev VI, Drushlyak KN, Dobrynin VN, Filippov SA, Frank-Kamenetskii MD. DNA H form requires a homopurine-homopyrimidine mirror repeat. Nature. 1987 Dec 3-9;330(6147):495-7.

Voloshin ON, Mirkin SM, Lyamichev VI, Belotserkovskii BP, Frank-Kamenetskii MD. Chemical probing of homopurine-homopyrimidine mirror repeats in supercoiled DNA. Nature. 1988;333(6172):475-6.

Sprizhitskii IuA, Nechipurenko IuD, Aleksandrov AA, Vol'kenshtein MV. Characteristics of nucleotide blocks in coding and non-coding DNA sequences from different organisms. Mol Biol (Mosk). 1988;22(2):338-56.

Suboch GM, SPrizhitsky YuA. Statistical significance of the occurrence of some comPlex nucleotide combinations: comParison of the DNA models. BioPolym. Cell. 1989; 5(4):30-7.

Efron B. Bootstrap Methods: Another Look at the Jackknife. Ann Stat. 1979;7(1):1–26.

Diakonis P, Efron B. Statistical methods with intensive use of comPuters. In the world of science. 1983; 7:60-73.

GetiBatik (1986). Genetic sequence data bank, R. 44.0. BBN laboratories, USA.

Beckmann JS, Brendel V, Trifonov EN. Intervening sequences exhibit distinct vocabulary. J Biomol Struct Dyn. 1986;4(3):391-400.

Завантаження

Опубліковано

1989-07-20

Номер

Розділ

Структура та функції біополімерів