Матрицезалежне зв’язування аміноацил-тРНК з А-ділянкою 70S рибосом Escherichia coli за відсутності транспептидації
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0000C2Анотація
Виміряно константи асоціації Phe-тPHKPhe з А-ділянкою 70S рибосом за умов блокування її зв’язування з P-ділянкою деацильованої тPHKPhe. По залежності величини константи асоціації від температури розраховано ентальпію (ΔH0 ~ 11 ккал /моль) і ентропію (ΔS0 ~ –5 кал ·моль–1·град–1) цієї взаємодії. Константа асоціації Phe-tPHKPhe, виміряна за температури 0 оC і блокування Р-ділянки нерозщеплюваним аналогом пептидил-тРНК, добре узгоджується з цією залежністю. Приблизно два іони магнію прямо або опосередковано беруть участь у матричнозалежній взаємодії Phe-тPHKPhe з А-ділянкою 70S рибосом.Посилання
Kemkhadze KSh, Odintsov VB, Makhno VI, Semenkov IuP, Kirillov SV. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes. Interaction of aminoacyl-tRNA with 70S ribosomes in the absence of elongation factor EF-Tu and GTP. Mol Biol (Mosk). 1981;15(4):779-89.
Kirillov SV, Kemkhadze KS, Makarov EM, Makhno VI, Odintsov VB, Semenkov YP. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes: codon-anticodon interaction of aminoacyl-tRNA at the ribosomal donor site. FEBS Lett. 1980;120(2):221-4.
Kirillov SV, Makhno VI, Semenkov YP. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes. Direct functional evidence that isolated 30S subunits contain two codon-specific binding sites for transfer RNA. Nucleic Acids Res. 1980;8(1):183-96.
Kemkhadze KS, Odintsov VB, Semenkov YP, Kirillov SV. Quantitative study of the interaction of aminoacyl-tRNA with the a site of Escherichia coli ribosomes: equilibrium and kinetic parameters of binding in the absence of EF-Tu factor and GTP. FEBS Lett. 1981;125(1):10-4.
Peters M, Yarus M. Transfer RNA selection at the ribosomal A and P sites. J Mol Biol. 1979;134(3):471-91.
Semenkov IuP, Makhno VI, Makarov EM, Kirillov SV. The effect of the antibiotic edeine on tRNA interaction with A, P and E sites of Escherichia coli 70S ribosomes. Mol Biol (Mosk). 1984;18(5):1348-51.
Katunin VI, Semenkov YP, Makhno VI, Kirillov SV. Comparative study of the interaction of polyuridylic acid with 30S subunits and 70S ribosomes of Escherichia coli. Nucleic Acids Res. 1980;8(2):403-21.
Semenkov YuP, Makarov EM, Kirillov SV. Quantitative study of interaction of deacylated tRNA with the P, A and E sites of Escherichia coli ribosomes. Biopolym. Cell. 1985; 1(4):183-93.
Grajevskaja RA, Ivanov YV, Saminsky EM. 70-S ribosomes of Escherichia coli have an additional site for deacylated tRNA binding. Eur J Biochem. 1982;128(1):47-52.
Kirillov SV, Makhno VI, Odinzov VB, Semenkov YP. The mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes. Heterogeneity of tRNA complexes with 70-S ribosomes of Escherichia coli. Eur J Biochem. 1978;89(1):305-13.
Kirillov SV. Mechanism of codon-anticodon interaction in the ribosomes. Results of science and technology. Moscow, VINITI, 1983; 5-98. (Biol. chemistry; Vol. 18).
Makarov EM, Katunin VI, Odintsov VB, Semenkov IuP, Kirillov SV. How do ribosome binding sites recognize the functional state of tRNA?. Mol Biol (Mosk). 1984;18(5):1342-7.
