Встановлення штамової приналежності українських ізолятів вірусу жовтої мозаїки цукіні та їх поширення на території України
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000926Ключові слова:
вірус жовтої мозаїки цукіні, агроценози, штами, філогенетичний аналізАнотація
Мета. Встановити штамову приналежність українських ізолятів вірусу жовтої мозаїки цукіні та дослідити їх поширення на території України. Методи. У роботі були використані наступні методи: візуальна діагностика, імуноферментний аналіз, ЗТ-ПЛР, сиквенування та філогенетичний аналіз. Результати. Перевірено рослини родини Cucurbitaceae на наявність антигенів вірусу жовтої мозаїки цукіні (ВЖМЦ). Встановлено, що 41 % перевірених рослин родини Cucurbitaceae уражені вірусом жовтої мозаїки цукіні. Вірусінфіковані рослини були наявні в агроценозах Вінницької, Запорізької, Київської, Полтавської та Черкаської областей. У результаті проведення ЗТ–ПЛР було отримано продукти ампліфікації розміром 605 п.о., що відповідає за розміром ділянці геному, яка кодує Nib/CP вірусу жовтої мозаїки цукіні. За результатами даних сиквенсу побудувано філогенетичне дерево виділених ізолятів ZYMV. Висновки. Ідентифікація інфікованих рослин у 5 із 9 обстежуваних агроценозів показала широке розповсюдження ZYMV в Україні. Топологія філогенетичного дерева показує, що ізоляти ZYMV формують три групи. Філогенетичне положення на дереві українських ізолятів ZYMV показує їх приналежність до групи А підгрупи 1. Ця група є найбільш чисельною та її представники мають широке географічне поширення. Ізоляти ZYMV, що циркулюють в Україні, виявилися близькоспоріднені між собою. Відсоток ідентичності між ними знаходиться в діапазоні від 99,7 до 100. Дані ізоляти ZYMV мають спільне походження з європейськими ізолятами з Австрії (AJ420017), Словенії (AJ420018), Сербії (HM072432), Угорщини (AJ459955), Словаччини (DQ124239). Відсоток ідентичності між українськими та європейськими ізолятами знаходиться в межах від 94,3 до 100.Посилання
Desbiez C, Lecoq H. Zucchini yellow mosaic virus. Plant Pathol. 1997; 46(6):809–29.
Fauquet C, Mayo MA, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA. Virus taxonomy. VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Academic Press, 2004. 1162 p.
Gal-On A. Zucchini yellow mosaic virus: insect transmission and pathogenicity -the tails of two proteins. Mol Plant Pathol. 2007;8(2):139-50.
Rudneva TO, Shevchenko TP, Boyko AL. Vlastyvosti virusu zhovtoi mozaiky cukkini, izolovanogo z roslyn rodyny Cucurbitaceae. Agroekologichnyy Zhurnal. 2008. Sp ed:205-7.
Desbiez C, Wipf-Scheibel C, Lecoq H. Biological and serological variability, evolution and molecular epidemiology of Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV, Potyvirus) with special reference to Caribbean islands. Virus Res. 2002;85(1):5-16.
Yakoubi S, Desbiez C, Fakhfakh H, Wipf-Scheibel C, FabreF, Pitrat M, Marrakchi M, Lecoq H. Molecular, biological and serological variability of Zucchini yellow mosaic virus in Tunisia. Plant Pathol. 2008;57(6):1146-54
Polischuk VP, Budzanivska IG, Shevchenko TP. Posibnyk praktychnyh zanyatt do kursu «Zagalna Virusologia». Kyiv: "Fotosociotsentr", 2005; 129-133.
Antibodies. A practical approach. Ed Catty D. IRL Press, 1989; 280 p.
Gnutova RV. Serologia i immunokhimia virusov rasteniy. M.: Nauka, 1993. 301 p.
QIAGENR. One step RT-PCR Kit Handbook. Quiagen, 2002. 39p.
Safaeizadeh M. Comparative biological and molecular variability of Zucchini yellow mosaic virus in Iran. Asian J Plant Pathol. 2008; 2(1):30-9.
Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol Biol Evol. 2013;30(12):2725-9.
