Взаємодія PARP2 зі структурами ДНК, імітуючими інтермедіати процесів репарації ДНК
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000129Ключові слова:
PARP1, PARP2, полі(ADP-рибозил)ювання, зв’язування ДНКАнотація
Полі(ADP-рибозил)ювання – це тип посттрансляційної модифікації білків, який є важливим для забезпечення стабільності геному та виживання клітин у відповідь на пошкодження ДНК. Полі (ADP-рибозил)ювання каталізується полі(ADP-рибоза)полімеразами (PARP). У той час як роль PARP1 у клітинній відповіді на пошкодження ДНК детально досліджено, внесок іншої ДНК-залежної полі(ADP-рибоза)полімерази – PARP2 – вивчено поки що слабко. Мета. Виявити специфічні ДНК-мішені PARP2. Методи. Метод «затримки в гелі» (EMSA) і тест активності PARP. Результати. Проведено оціночні виміри значень Kd комплексів PARP2– ДНК для деяких структур ДНК, імітуючих інтермедіати різних процесів метаболізму ДНК, а також ці ДНК проаналізовано як «активатори» PARP1 і PARP2 у синтезі полі(ADP-рибози). Висновки. Як і для PARP1, для PARP2 не спостерігається кореляції між ефективністю активації та значенням Kd для різних ДНК. Найефективніше PARP2 активується за присутності over5DNA.Посилання
Oliver A. W., Ame J. C., Roe S. M., Good V., de Murcia G., Pearl L. H. Crystal structure of the catalytic fragment of murine poly (ADP-ribose) polymerase-2 Nucleic Acids Res 2004 32, N 2 P. 456–464.
Sukhanova M. V., Khodyreva S. N., Lavrik O. I. Poly(ADP-ribose) polymerase-1 inhibits strand-displacement synthesis of DNA catalyzed by DNA polymerase beta Biochemistry (Moscow) 2004 69, N 5 P. 558–568.
Ame J. C., Rolli V., Schreiber V., Niedergang C., Apiou F., Decker P., Muller S., Hoger T., Menissier-de Murcia J., de Murcia G. PARP-2, A novel mammalian DNA damage-dependent poly (ADP-ribose) polymerase J. Biol. Chem 1999 274, N 25 P. 17860–17868.
D'Silva I., Pelletier J. D., Lagueux J., D'Amours D., Chaudhry M. A., Weinfeld M., Lees-Miller S. P., Poirier G. G. Relative affinities of poly(ADP-ribose) polymerase and DNA-dependent protein kinase for DNA strand interruptions Biochim. Biophys. Acta 1999 1430, N 1 P. 119–126.
Pion E., Ullmann G. M., Ame J C., Gerard D., de Murcia G., Bombarda E. DNA-induced dimerization of poly(ADP-ribose) polymerase-1 triggers its activation Biochemistry 2005 44, N 44 P. 14670–14681.
