Субстратна специфічність і біологічна роль зворотної гірази з екстремально термофільних архебактерій
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.00021CАнотація
Зворотну гіразу виділено з нової архебактерії D. amylolythicus. Показано, що однониткова ДНК інгібує дію зворотної гірази. На прикладі гетеродуплексної ДНК, сконструйованої на основі двох плазмід, одна з яких має коротку вставку відносно іншої, показано, що фермент може створювати додаткові позитивні надвитки у початково позитивно надспіралізованій ДНК, якщо у складі такої ДНК є однониткова ділянка. Ці результати означають, що зворотна гіраза подібно еубактерійній топоізомеразі I специфічна до однониткової ДНК. Завдяки такій специфічності зворотна гіраза може підтримувати оптимальний рівень позитивної надспіралізації в екстремальних термофілах і тим самим стабілізувати ДНК цих організмів.Посилання
Stetter KO, K?nig H, Stackebrandt E. Pyrodictium gen. nov., a New Genus of Submarine Disc-Shaped Sulphur Reducing Archaebacteria Growing Optimally at 105°C. Syst Appl Microbiol. 1983;4(4):535-51.
Nakasu S, Kikuchi A. Reverse gyrase; ATP-dependent type I topoisomerase from Sulfolobus. EMBO J. 1985;4(10):2705-10.
Forterre P, Mirambeau G, Jaxel C, Nadal M, Duguet M. High positive supercoiling in vitro catalyzed by an ATP and polyethylene glycol-stimulated topoisomerase from Sulfolobus acidocaldarius. EMBO J. 1985;4(8):2123-8.
Slesarev AI. Positive topoisomerase activity revealed in a new extreme-thermophilic anaerobic Archaebacterium, reducing sulfur. Biopolym Cell. 1988; 4(1):28-34.
Nadal M, Mirambeau G, Forterre P, Reiter W-D, Duguet M. Positively supercoiled DNA in a virus-like particle of an archaebacterium. Nature. 1986; 321(6067):256-258.
Maniatis T., Fritsch E. E., Sambrook J. Molecular cloning. A laboratory manual. New York : Cold Spring Harbor Lab., 1982-390 p.
Kirkegaard K, Wang JC. Bacterial DNA topoisomerase I can relax positively supercoiled DNA containing a single-stranded loop. J Mol Biol. 1985;185(3):625-37.
Panyutin I, Lyamichev V, Mirkin S. A structural transition in d(AT)n.d(AT)n inserts within superhelical DNA. J Biomol Struct Dyn. 1985;2(6):1221-34.
Wang JC. DNA topoisomerases. Annu Rev Biochem. 1985;54:665-97.
