Геномна мінливість у калюсних культурах кукурудзи лінії Р346 і отриманих від неї сомаклональних ліній

Автор(и)

  • Д. М. Майданюк Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 Автор
  • І. О. Андрєєв Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 Автор
  • К. В. Спірідонова Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 Автор
  • В. А. Кунах Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 Автор

DOI:

https://doi.org/10.7124/bc.00077C

Ключові слова:

кукурудза, культура тканин рослин, сомаклональні лінії, RAPD-аналіз, геномні перебудови

Анотація

Методом RAPD-аналізу досліджено калюсні тканини індивідуальних рослин кукурудзи лінії Р346 і отриманих від неї через культуру тканин in vitro сомаклональних ліній з підвищеною регенераційною здатністю. Геномні зміни в культивованих тканинах спостерігали вже в двомісячних калюсах, але після чотирьох місяців культивування їхній рівень знижувався майже вдвічі. Відмічено появу однотипних змін ДНК в калюсах, отриманих від різних рослин окремих ліній, що свідчить про можливість існування в геномі кукурудзи «гарячих точок» мінливості. Показано, що сомаклональні лінії відрізняються за рівнем генетичної мінливості в культурі in vitro.

Посилання

Jain SM. Tissue culture-derived variation in crop improvement. Euphytica. 2004; 118(2): 153-66.

Checheneva TN, Gur'eva IA. Comparative study somaclonal inbred maize lines for quantitative traits. Genetics in Ukraine at the turn of the millennium. K.: Logos, 2001. Vol 1:586-9.

Checheneva TM. Spontaneous and induced variability of maize in vitro: Thesis.... Dr biol nauk: 03.00.15. Institute of Plant Physiology and Genetics, National Academy of Sciences of Ukraine. K., 2003. 302 p.

Maidanyuk DM, Andreev IO, Spiridonova KV, Kunakh VA. Genetic polymorphism of the maize somaclonal lines derived from P346 line. Biopolym Cell. 2007; 23(4):324-31.

Murashige T, Skoog F. A revised medium for rapid growth and bio assays with tobacco tissue cultures. Physiol Plant. 1962;15(3):473–97.

Rogers SO, Bendich AJ. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues. Plant Mol Biol. 1985;5(2):69-76.

Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.

Yeh FC, Rongcai Y, Boyle T. POPGENE. Version 1.31. Edmonton: Univ. Alberta,1999.

Nei M. Genetic Distance between Populations. Am Nat. 1972;106(949):283-92.

Kumar S, Tamura K, Nei M. MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment. Brief Bioinform. 2004;5(2):150-63.

Williams JG, Kubelik AR, Livak KJ, Rafalski JA, Tingey SV. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 1990;18(22):6531-5.

Osipova ES, Koveza OV, Troitskiĭ AV, Dolgikh IuI, Shamina ZB, Gostimskiĭ SA. [Analysis of specific RAPD- and ISSR-fragments in somaclonal maize (Zea mays L.) and development of SCAR markers based on them]. Genetika. 2003;39(12):1664-72.

Maidanyuk DN, Andreev IO, Spiridonova KV, Checheneva TN, Kunakh VA. Genome variaability of maize line Black Mexican Sweet Corn C456 in tissue culture in vitro: RAPD-amalysis results. Visn Ukr Tov Genet Sel. 2006; 4(1): 58-67.

Godwin ID, Sangduen N, Kunanuvatchaidach R, Piperidis G, Adkins SW. RAPD polymorphisms among variant and phenotypically normal rice ( Oryza sativa var. indica ) somaclonal progenies. Plant Cell Rep. 1997; 16(5): 320-4.

Linacero R, Freitas Alves E, V?zquez AM. Hot spots of DNA instability revealed through the study of somaclonal variation in rye. Theor Appl Genet. 2000;100(3-4):506–11.

Mangolin CA, Ottoboni LM, Machado Mde F. RAPD markers to evaluate callus tissue of Cereus peruvianus Mill. (Cactaceae) maintained in different growth regulator combinations. Biochem Genet. 2002;40(9-10):351-8.

Bogani P, Simoni A, Lio' P, Scialpi A, Buiatti M. Genome flux in tomato cell clones cultured in vitro in different physiological equilibria. II. A RAPD analysis of variability. Genome. 1996;39(5):846-53.

Fourre J-L, Berger P, Niquet L, Andre P. Somatic embryogenesis and somaclonal variation in Norway spruce: morphogenetic, cytogenetic and molecular approaches. Theor Appl Genet.1997;94(2):159–69.

Gallego FJ, Martinez I, Celestino C, Toribio M. Testing Somaclonal Variation Using RAPDs in Quercus suber L. Somatic Embryos. Int J Plant Sci. 1997;158(5):563-7.

Xie QJ, Oard JH, Rush MC. Genetic Analysis of an Unstable, Purple-Red Hull Rice Mutation Derived from Tissue Culture. J Hered. 1995; 86(2): 154-6.

Rani V, Parida A, Raina SN. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers for genetic analysis in micropropagated plants of Populus deltoides Marsh. Plant Cell Rep. 1995;14(7):459-62.

Polanco C, Ruiz ML. AFLP analysis of somaclonal variation in Arabidopsis thaliana regenerated plants. Plant Sci. 2002;162(5):817–24.

Опубліковано

2007-09-20

Номер

Розділ

Геном та його регуляція