Спричинена адсорбцією лігандів інверсія відносної стабільності АТ- і GC-пар основ ДНК
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.00020CАнотація
Теоретично досліджується інверсія відносної стабільності AT-і GC-пар підстав комплексів блокової ДНК з лігандами, що характеризуються дальнім порядком взаємодії при адсорбції, і ДНК з випадковою послідовністю пар основ з контактно взаємодіючими лігандами. Показано, що обидва типи взаємодії лігандів з ДНК обумовлюють нелінійність залежності температури плавлення від GC-змісту (Тm (х)), що викликає значне збільшення ширини температурного інтервалу переходу (ΔT) в точці інверсії. Встановлено, що тільки непротяжних невзаимодействующие між собою при адсорбції на ДНК ліганди, що зв'язуються сильніше з межами між спіральними і розплавленими ділянками, здатні викликати збільшення AT в точці інверсії при лінійності залежності Тm (х).Посилання
Voskoboinik AD, Monaselidze DR, Mgeladze GN, Chanchalashvili ZI, Lazurkin IuS, Frank-kamenetskii IM. Study of DNA melting in the region of the inversion of relative stability of AT and GC pairs. Mol Biol (Mosk). 1975;9(5):783-90.
Belintsev BN, Vologodskii AV, Frank-Kamenetskii MD. Influence of base sequence on the stability of the double helix of DNA. Mol Biol (Mosk). 1976;10(4):629-33.
Akhrem AA, Lando DIu. Effect of selectively reacting ligands on the helix-coil transition of DNA. III. Calculation of the melting curves of DNA-ligand complexes. Mol Biol (Mosk). 1981;15(5):1083-92.
Lando DYu, Shpakovskiy AG, Akhrem AA. The effect of long-range interactions between adsorbed ligands on the DNA helix-coil transition. Vestsi Akad nauk Bel. SSR. Ser. Khim. Nauk. 1984; 5:21-3.
Akhrem AA, Fridman AS, Lando DYu. Theory of helix-coil transition of the heterogeneous DNA-heteroqeneous ligands complexes. Biopolym. Cell. 1985; 1(4):171-9.
Lando DIu, Kul'ba AM, Akhrem AA. Effect of selectively reacting ligands on the helix-coil transition of DNA. IV. Heat denaturation of DNA in an acid medium. Mol Biol (Mosk). 1981;15(5):1093-1101.
Lando DYu, Friedman AS. Cooperative contact interaction between the ligands adsorbed on DNA, causes a decrease in the width of the melting range. Thes. of reports. V All-Union conf. on spectroscopy for biopolymers. Kharkiv, 1984; 251.
Tachibana H, Wada A. Ligand-induced melting reaction of specific-sequence DNA molecules. Biopolymers. 1982;21(9):1873-85.
Lyubchenko YL, Frank-Kamenetskii MD, Vologodskii AV, Lazurkin YS, Gause GG Jr. Fine structure of DNA melting curves. Biopolymers. 1976;15(6):1019-36.
Raukas E, Räim T. Thermal denaturation of distamycin A--DNA complexes as followed by hyperchromic spectra. Biophys Chem. 1980;11(2):233-7.
Blagoi IuP, Sorokin VA, Valeev VA, Gladchenko GO. Characteristics of the spiral sphere transition in DNA in a region of inversion of the relative stability of GC- and AT-pairs caused by Cu2+ and Mn2+ ions. Dokl Akad Nauk SSSR. 1978;240(2):459-62.
Melchior WB Jr, Von Hippel PH. Alteration of the relative stability of dA-dT and dG-dC base pairs in DNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 1973;70(2):298-302.
Record MT Jr, Woodbury CP, Inman RB. Characterization of rodlike RNA fragments. Biopolymers. 1975;14(2):393-408.
Woodbury CP, Record MT. A range of G+C-independent denaturation solvents for DNA. Biopolymers 1975; 14(11):2417-20.
Monaselidze DR, Mgeladze GN. Thermal properties of DNA and polydeoxyribonucleotides in a wide range of ionic concentration of neutral salts and a polymer. Biofizika. 1977;22(5):950-8. Russian.
Shapiro JT, Stannard BS, Felsenfeld G. The binding of small cations to deoxyribonucleic acid. Nucleotide specificity. Biochemistry. 1969;8(8):3233-41.
Gabrielian AG. Conformational transitions of DNA in concentrated neutral salt solutions. Biofizika. 1979;24(4):620-32.
