Квантово-хімічне моделювання радіаційних ушкоджень компонентів ДНК при непружній взаємодії з повільними електронами. Опромінення дезоксирибози
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0006FCКлючові слова:
2-дезокси-β-D-рибоза, метод AMI, енергія розпаду, аніонні продукти, електронАнотація
Методом молекулярних орбіталей самоузгодженого поля у наближенні AMI розраховано повні енергії та теплоти утворення продуктів розпаду дезоксирибози при її взаємодії з монохроматичним електронним пучком. Дисоціативне приєднання повільних електронів має місце вже при енергії, близькій до нуля, хоча електронна спорідненість молекули дезоксирибози негативна (-2 еВ), що вказує на тунельний механізм реакції взаємодії електрона з молекулою. Результати розрахунку енергій для всіх каналів розпаду аніонних напівпродуктів добре якісно узгоджуються з експериментом для ефективного перетину диссціативного захоплення електрона.Посилання
Dugas Hermann, Penney C. Bioorganic Chemistry. A Chemical Approach to Enzyme Action. Springer 1981.
Von Sonntag C. The chemical basis of radiation biology. London: Taylor and Francis, 1987. 116 p.
Ptasi?ska S, Denifl S, Scheier P, M?rk TD. Inelastic electron interaction (attachment/ionization) with deoxyribose. J Chem Phys. 2004;120(18):8505-11.
Bouda?ffa B, Cloutier P, Hunting D, Huels MA, Sanche L. Resonant formation of DNA strand breaks by low-energy (3 to 20 eV) electrons. Science. 2000;287(5458):1658-60.
Abouaf R, Pommier J, Dunet H. Negative ions in thymine and 5-bromouracil produced by low energy electrons. Int J Mass Spectrom. 2003;226(3):397-403.
Barrios R, Skurski P, Simons J. Mechanism for Damage to DNA by low-energy electrons. J Phys Chem B. 2002;106(33):7991–4.
Dewar MJS, Thiel W. Ground states of molecules. 38. The MNDO method. Approximations and parameters. J Am Chem Soc. 1977;99(15):4899–907.
Dewar MJS, Zoebisch EG, Healy EF, Stewart JJP. Development and use of quantum mechanical molecular models. 76. AM1: a new general purpose quantum mechanical molecular model. J Am Chem Soc. 1985;107(13):3902–9.
Deeble DJ, Schulz D, von Sonntag C. Reactions of OH radicals with poly(U) in deoxygenated solutions: sites of OH radical attack and the kinetics of base release. Int J Radiat Biol Relat Stud Phys Chem Med. 1986;49(6):915-26.