Вплив вибіркового зв’язування лігандів на молекулярне плавлення ДНК
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0001F0Анотація
Проведено теоретичний аналіз впливу непротяжних невзаємодіючих між собою при адсорбції лігандів з вибірковим характером зв’язування на перехід спіраль-клубок ДНК. Встановлено, що за безпосереднього зв’язування лігандів і у разі опосередкованого впливу розчинених речовин на теплову денатурацію ДНК має місце збіг характеристик процесу плавлення. Різниця спостерігається лише за великих температурних зсувів, обумовлених лігандами (більших за 40 °С), що пов’язано з нелінійністю залежності температури плавлення від GC-вмісту комплексу. Встановлено, що для ДНК з квазівипадковою і блоковою послідовностями пар основ ліганди обумовлюють однакові температурні зсуви, але різний характер залежності ширини температурного інтервалу переходу від концентрації.Посилання
Voskoboinik AD, Monaselidze DR, Mgeladze GN, Chanchalashvili ZI, Lazurkin IuS, Frank-kamenetskiĭ IM. Study of DNA melting in the region of the inversion of relative stability of AT and GC pairs. Mol Biol (Mosk). 1975;9(5):783-90.
Akhrem AA, Lando DIu. Influence of ligands characteristic of selective binding to a certain type of base pairs on DNA helix-coil transition I. Model. Theory. Mol Biol (Mosk). 1979;13(5):1098-109.
Akhrem AA, Lando DIu. Influence of ligands selective nature of the interaction at the helix - a tangle of DNA containing satellite fraction. Vestsi AN BSSR. Ser. Khim. 1981; (2):13-9.
Akhrem AA, Lando DIu. Effect of selectively reacting ligands on the helix-coil transition of DNA. III. Calculation of the melting curves of DNA-ligand complexes. Mol Biol (Mosk). 1981;15(5):1083-92.
Lando DIu, Kul'ba AM, Akhrem AA. Effect of selectively reacting ligands on the helix-coil transition of DNA. IV. Heat denaturation of DNA in an acid medium. Mol Biol (Mosk). 1981;15(5):1093-1101.
Akhrem AA, Fridman AS, Lando DYu. Theory of helix-coil transition of the heterogeneous DNA-heteroqeneous ligands complexes. Biopolym Cell. 1985; 1(4):171-179
Lyubchenko YL, Frank-Kamenetskii MD, Vologodskii AV, Lazurkin YS, Gause GG Jr. Fine structure of DNA melting curves. Biopolymers. 1976;15(6):1019-36.
Tong BY, Battersby SJ. Melting fine structure of ϕX174 DNA and its fragments: A theroetical study. Biopolymers. 1978; 17(12):2933-7.
Frank-Kamenetskii MD, Frank-Kamenetskii AD. Accounting for double-stranded in the theory of the helix - coil transition of DNA. Molekulyarnaya biologiya. 1969; 3(3):375-83.
Fridman AS, Lando Diu. Cooperative contact interaction between the ligands adsorbed on DNA, causes a decrease in the width of the melting range. 5th all-union conf. on spectroscopy of biopolymers: Proc. of reports. Kharkov, 1984; 254.
Belintsev BN, Vologodskii AV, Frank-Kamenetskii MD. Influence of base sequence on the stability of the double helix of DNA. Mol Biol (Mosk). 1976;10(4):629-33.
