Нова модифікація безмодельного підходу до аналізу даних щодо ядерної магнітної релаксації у білках

Автор(и)

  • В. Д. Федотов Інститут біології Казанська філія АН СРСР Казань, СРСР Автор
  • Л. С. Ківаєва Інститут біології Казанська філія АН СРСР Казань, СРСР Автор

DOI:

https://doi.org/10.7124/bc.0001EC

Анотація

Розвинуто формальний підхід до аналізу релаксації ядер 13С у білках. Внутрішньомолекулярний рух протонованих вуглеводів описується узагальненими мікродинамічними параметрами: фактором анізотропії (мірою просторової обмеженості) і розподілом часів кореляції. Обговорюється зв’язок формальних параметрів з параметрами деяких моделей руху.

Посилання

Jardetzky O, Roberts GCK. NMR in molecular biology. New York; London: Acad, press, 1981. 380 p.

Debrunner PG, Frauenfelder H. Dynamics of proteins. Ann Rev Phys Chem. 1982; 33(1):283-299.

Karplus M. Dynamics of proteins. Proc. 2th SUNYA conversation in the discipi. biomol. stereodynamics. New York: Adenine press, Vol. 2:211-228.

Abaturov LV. Thermal movements of proteins: small-scale fluctuation and conformation substates. Mol Biol (Mosk). 1983;17(4):683-704.

Abaturov LV, Lebedev IuO, Nosova NG. Dynamic structure of globular proteins: conformational rigidity and fluctuational motility. Mol Biol (Mosk). 1983;17(3):543-68.

Grivtsov AG, Malenkov GG, Abaturov LV. Computer simulation of protein molecular dynamics. Mol Biol (Mosk). 1983;17(3):587-615.

Abaturov LV, Burshtein EA, Ivanov VI. Equilibrium dynamics of biopolymers structure. Mol Biol (Mosk). 1983;17(3):451-454.

Ribeiro AA, King K, Restivo Ch, Jardetzky O. An approach to the mapping of internal motions in proteins. Analysis of carbon-13 NMR relaxation in the bovine pancreatic trypsin inhibitor. J Amer Chem Soc. 1980; 102(12):4040-51.

Lipari G, Szabo A. Model-free approach to the interpretation of nuclear magnetic resonance relaxation in macromolecules. 1. Theory and range of validity. J Amer Chem Soc. 1982; 104(17):4546-59.

Lipari G, Szabo A. Model-free approach to the interpretation of nuclear magnetic resonance relaxation in macromolecules. 2. Analysis of experimental results. J Amer Chem Soc. 1982; 104(17)::4559-4570.

Fedotov VD. Pulsed NMR in block polymers. Dis .... Doctor. Sci. Sciences: Kazan, 1981. p. 254-273.

Fedotov VD, Kivaeva LS. Characteristics and mechanisms of intramolecular motion in globular proteins according to the magnetic relaxation of 13C nuclei. Phys-Chem. properties of biopolymers in solution and cells (23-26 Sept. 1985, Pushchino.) Pushchino, 1985:106.

Fedotov V. D. NMR relaxation and molecular dynamics in polymers and biopolymers. Progress in polymer spectroscopy: Proc. 7th Eur. symp. on polymer spectroscopy (15-18 Oct. 1985, Leipzig). Leipzig, 1986:262-271.

Fuoss R, Kirkwood JG. Electrical Properties of Solids. VIII. Dipole Moments in Polyvinyl Chloride-Diphenyl Systems. J Amer Chem Soc. 1941; 63(2):385-94.

Chernov VM, Fedotov VD. Nuclear magnetic relaxation and nature of the distribution of the correlation time of segmental movement in rubbers. Polymer Science U.S.S.R. 1981; 23(4):1042-54.

Kaplan JI, Garroway AN. Homogeneous and inhomogeneous distributions of correlation times. Lineshapes for chemical exchange. J Magn Reson. 1982; 49(3):464-75.

Lipari G, Szabo A, Levy RM. Protein dynamics and NMR relaxation: comparison of simulations with experiment. Nature. 1982; 300(5880):197-198.

Khazanovich T.N, Mironou VD. N.M.R. line shape and spin-locking in slowly tumbling methyl groups. Mol Phys. 1985; 55(1):145-59.

Woessner DE. Spin Relaxation Processes in a Two-Proton System Undergoing Anisotropic Reorientation J. Chem. Phys. 1962; 36(1):1-4.

Glarum SH. Dielectric Relaxation of Isoamyl Bromide. J. Chem. Phys. 1960; 33(3):639-43.

Voigt G, Kimmich R. Chain fluctuations in the amorphous regions of polyethylene as indicated in proton relaxation spectroscopy. Polymers. 1980; 21(9):1001-8.

Cole KS, Cole RH. Dispersion and Absorption in Dielectrics I. Alternating Current Characteristics. J Chem Phys. 1941; 9(4):341-351.

Davidson VC, Cole RH. Dielectric Relaxation in Glycerol, Propylene Glycol, and n-Propanol. J Chem Phys. 1951; 19(12):1484-90.

Завантаження

Опубліковано

1987-07-20

Номер

Розділ

Структура та функції біополімерів