Аналіз антигенної структури українських штамів М-вірусу картоплі

Автор(и)

  • С. С. Вітер Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії НАН України вул. Мурманська, 1, Київ, Україна, 02094 Автор
  • Т. Ю. Ткаченко Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії НАН України вул. Мурманська, 1, Київ, Україна, 02094 Автор
  • Л. П. Коломієць Інститут сільськогосподарської мікробіології та агропромислового виробництва НААН вул. Шевченка, 97, Чернігів, Україна, 14027 Автор
  • Ю. Л. Радавський Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії НАН України вул. Мурманська, 1, Київ, Україна, 02094 Автор

DOI:

https://doi.org/10.7124/bc.000577

Анотація

Для аналізу антигенної структури білка оболонки двох українських штамів М-вірусу картоплі (PVM) VI та V7 використано три моноклональних антитіаа (МКА) проти PVМ. Фрагменти 22Glu-Lys35 та 22Gly-Lys35 , одержані після ферментативного гідролізу трипсином білків оболонки двох штамів PVM, розпізнавалися двома МКА – M6D5 та M9G1. Заміна Glu -> Gly в позиції 22 білка оболонки PVM V7 не змінювала розпізнавання антитілами як триптичних пептидів, так і білків оболонки цих штамів. МКА M9G1 та М4С1 конкурували між собою за ділянки зв'язування з молекулою білка оболонки PVM. Синтетичний пептид П14, який відповідав фрагментові 22Glu-Lys35 , з різною ефективністю пригнічував взаємодію МКА M6D5 та M9G1 з фрагментом П14 і білкооболонки РУМ. Зміна позитивного заряду бокової группи на від'ємний шляхом модифікації пептидів 22Glu-Lys35 та 22Gly-Lys35цитраконовим ангідридом призвела до дворазового посилення реакції МКА M9G1 та до незначного зниження реакції МКА M6D5 з модифікованим пептидом. На підставі одержаних результатів встановлено, що PVM-специфічні епітопи розташовані в N-кінцевій області білка оболонки. Два епітопи, які розпізнаються МКА M6D5 та M9G1, перекриваються та мають загальну ділянку зв'язування у фрагменті 22Glu/Gly-Lys35 . Епітопи, які розпізнаються МКА M4C1 та M9G1, або перекриваються між собою, або конформаційно наближені один до одного.

Посилання

Tavantzis SM. Improved purification of two potato carlaviruses. Phytopathology. 1983; 73(2): 190-4.

Tavantzis SM. Physicochemical properties of potato virus M. Virology. 1984;133(2):427-30.

Zavriev SK, Kanyuka KV, Levay KE. The genome organization of potato virus M RNA. J Gen Virol. 1991;72 ( Pt 1):9-14.

Gramstat A, Courtpozanis A, Rohde W. The 12 kDa protein of potato virus M displays properties of a nucleic acid-binding regulatory protein. FEBS Lett. 1990;276(1-2):34-8.

Foster GD. The structure and expression of the genome of carlaviruses. Res Virol. 1992;143(2):103-12.

Wetter C, Milne RG. Carlaviruses. Handbook of plant virus infections and comparative diagnosis. Ed. E. Kurstak. Amsterdam; New York; Oxford: Elsevier. North-Holland Bio­chemical press, 1981: 685-730.

Viter SS, Raudsepp RA, Gavrish OG, Radavsky YuL. Localization of epitope on potato virus M coat protein. Doklady Akad Nauk Ukrainy. 1992;(9):162-4.

Foster GD, Mills PR. Analysis of the coat proteins of the ordinary and Andean strains of potato virus S and antigenic comparisons of carlaviruses. Acta Virol. 1992;36(2):184-90.

Cerovsk? N, Filigarov? M, Subr Z. Partial antigenic characterization of potato virus S (Andean strain) by monoclonal antibodies. Acta Virol. 1996;40(1):23-6.

Adams AN, Barbara DJ. The use of F(ab‘) 2 -based ELISA to detect serological relationships among carlaviruses . Ann Appl Biol. 1982;101(3):495–500.

J?rvek?lg L, S?ber J, Sinij?rv R, Toots I, Saarma M. Time-resolved fluoroimmunoassay of potato virus M with monoclonal antibodies. Ann Appl Biol. 1989;114(2):279–91.

Nikolaeva OV, Novikov VK Atabekov IG, Kaftanova AS. Changes antigenic properties of potato virus M at the progressive degradation of structural protein in the process of separation and storage. S-H. biology. 1985;10.:75-8.

Laemmli UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970;227(5259):680-5.

Wu GJ, Bruening G. Two proteins from cowpea mosaic virus. Virology. 1971;46(3):596-612.

Lowry OH, Rosebrough NJ, Farr AL, Randall RJ. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J Biol Chem. 1951;193(1):265-75.

Barany G, Merrifield RB. Solid-phase peptide synthesis. Peptides. Eds E. Gross, J. Meienhoter. New York: Acad, press, 1980. Vol. 2: 1-284.

Pitt-Rivers R, Impiombato FS. The binding of sodium dodecyl sulphate to various proteins. Biochem J. 1968;109(5):825-30.

Tozzini AC, Ek B, Palva ET, Hopp HE. Potato virus X coat protein: a glycoprotein. Virology. 1994;202(2):651-8.

Muller S, Plaue S, Couppez M, Van Regenmortel MH. Comparison of different methods for localizing antigenic regions in histone H2A. Mol Immunol. 1986;23(6):593-601.

Joisson C, Kuster F, Plau? S, Van Regenmortel MH. Antigenic analysis of bean pod mottle virus using linear and cyclized synthetic peptides. Arch Virol. 1993;128(3-4):299-317.

Rajashankar KR, Ramakumar S. Pi-turns in proteins and peptides: Classification, conformation, occurrence, hydration and sequence. Protein Sci. 1996;5(5):932-46.

Shukla DD, Strike PM, Tracy SL, Gough KH, Ward CW. The N and C Termini of the Coat Proteins of Potyviruses Are Surface-located and the N Terminus Contains the Major Virus-specific Epitopes. J Gen Virol. 1988;69(7):1497–508.

Radavsky YuL, Viter SS, Turova IP, Zaitseva LS, J?rvek?lg LV, Saarma MJu, Grebenshchikov NI, Baratova LA. Antigenic structure of the potato virus X coat protein. II. Localization of antigenic determinant(s) at the N-terminus of the protein. Bioorg Khim. 1989; 15 (5):615-9

Baratova LA, Grebenshchikov NI, Dobrov EN, Gedrovich AV, Kashirin IA, Shishkov AV, Efimov AV, J?rvek?lg L, Radavsky YL, Saarma M. The organization of potato virus X coat proteins in virus particles studied by tritium planigraphy and model building. Virology. 1992;188(1):175-80.

biopolym.cell-2000-16-4-cover.png

Завантаження

Опубліковано

2000-07-20

Номер

Том 16 № 4 (2000)

Розділ

Віруси та клітина