Вірус тютюнової мозаїки з рослинних асоціацій різних регіонів України як природний біоіндикатор
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.0004EDАнотація
Проведено скринінг інфікованого матеріалу рослин родини пасльонових різних регіонів України для здійснення екологічного моніторингу. Встановлено, що рослини цієї родини інфікуються в комплексі з вірусами різних груп, причому постійним учасником коінфекції є ВТМ. Виділено 16 ізолятів ВТМ (дев'ять з тютюну, сім з томату), отриманих відповідно з с. Народичі Житомирської обл. і Пущі-Водиці Київської обл. Проведено ПЛР-ампліфікацію одного з функціональних сайтів вірусного геному – ділянки, що кодує послідовність С-кінцевого фрагмента капсидного білка, з наступним сиквенуванням специфічного продукту реакції В результаті всі ізоляти можна віднести до раніше виділених у цих регіонах і охарактеризованих нами штамів TVM NT9 і TVM LE7. Одержані дані дозволяють зробити висновок щодо можливості використання ВТМ як моделі біологічного індикатора змін, які відбуваються в природних умовах. У свою чергу, його характеристики можуть являти собою реперні дані.Посилання
Boyko AL, Stepanujk SA, Garifulin OM. Sequencing analysis cDNA for C-terminus part of capsid protein for tomato TVM isolated from region with nuclear contamination. Biopolym Cell. 1996; 12(5):100-5.
Boyko AL, Stepanjuk SA, Garifulin OM. Obtaining and analysis of provirus cDNA for C-terminus part of capsid protein for tobacco TVM strain isolated from region with nuclear contamination. Biopolym Cell. 1996; 12(6):112-5.
Boyko AL. Ecology of plant viruses. K.: Vyshch sk, 1990; 167 p.
Boyko AL. Influence of environmental factors on viruses that infect plants. Selk-khoz. biologiia. 1989; 5:120-5.
Chumakon NE. Basic research methods phytopathologic. M.: Kolos, 1974. 158 p.
Gnutova RV. Immunological studies in phytovirology. Immunological methods in mass diagnosis of plant viruses. M.: VASKHNIL, 1986. 248 p.
Kiselev NA. Electron microscopy of biological molecules. M.: Nauka, 1965; 147 p.
Noordam D. Identification of plant viruses. Methods and experiments. Ed. D. Noordam. Wageningen: Pudoc, 1973. 277 p.
Laemmli UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970;227(5259):680-5.
Ruano G, Brash DE, Kidd KK. PCR. the first few cycles. Amplifications. 1991; (7): 1-4.
Bachmann B, L?ke W, Hunsmann G. Improvement of PCR amplified DNA sequencing with the aid of detergents. Nucleic Acids Res. 1990;18(5):1309.
Zaitlin M, Israel IW. Tobacco mosaic virus (type strain). CMI. AAB. Description of Plant Viruses. 1975; 151.
Harrison B. D. Potato mop-top virus. CMI. AAB. Description of Plant Viruses. 1974. N 138.
Radavsky YuV. Antigenic structure of the core proteins of plant viruses and protein antigens Bortetella pertussis: Auth Thesis. ... dr biol. nauk. Kiev, 1994. 32 p.
Tindall KR, Kunkel TA. Fidelity of DNA synthesis by the Thermus aquaticus DNA polymerase. Biochemistry. 1988;27(16):6008-13.
Gibbs AJ, Harrison BD. Plant virology : the principles. London : Edward Arnold, 1976; 292 p.
Mattila P, Korpela J, Tenkanen T, Pitk?nen K. Fidelity of DNA synthesis by the Thermococcus litoralis DNA polymerase--an extremely heat stable enzyme with proofreading activity. Nucleic Acids Res. 1991;19(18):4967-73.
