Biopolymers and cell. 2010; 26 (2): 146 - 152
Новий метод ідентификації ієрархії доменів у білках на основі даних молекулярної динаміки
С. О. Єсилевський
Мета. Незважаючи на велику кількість існуючих підходів до ідентифікації доменів у білках, на сьогодні немає єдиного загальновизнаного методу, який міг би визначати ієрархію динамічних доменів на основі даних молекулярної динаміки. Метою роботи є створення такого методу. Методи. Домени визначають рекурсивним елімінуванням систематичних рухів у траєкторіях молекулярної динаміки. Результати. Розроблено новий метод визначення ієрархії доменів на основі даних молекулярної динаміки, який отримав назву ієрархічного доменного вирівнювання (HDWA).
Ключові слова: динамічнi домени, ідентификація доменів, ієрархічне доменне вирівнювання, молекулярна динаміка.