Biopolymers and cell. 2010; 26 (2): 146 - 152
Новый метод идентификации иерархии доменов в белках на основе данных молекулярной динамики
С. А. Есилевский
Цель. Несмотря на большое количесто существующих подходов к определению доменов в белках, на сегодня нет единого общепризнанного метода, с помощью которого можно было бы идентифицировать иерархию динамических доменов на основе данных молекулярной динамики. Целью работы является разработка такого метода. Методы. Домены определяют рекурсивным элиминированием систематических движений в траекториях молекулярной динамики. Результаты. Создан новый метод определения иерархии доменов на основе данных молекулярной динамики, получивший название иерархического доменного выравнивания (HDWA).
Ключевые слова: динамические домены, идентификация доменов, иерархическое доменное выравнивание, молекулярная динамика.