Biopolymers and cell. 2010; 26 (2): 146 - 152

 

 

Новый метод идентификации иерархии доменов в белках на основе данных молекулярной динамики

 

С. А. Есилевский

 

 

Цель. Несмотря на большое количесто существующих подходов к определению доменов в белках, на сегодня нет единого общепризнанного метода, с помощью которого можно было бы идентифицировать иерархию динамических доменов на основе данных молекулярной динамики. Целью работы является разработка такого метода. Методы. Домены определяют рекурсивным элиминированием систематических движений в траекториях молекулярной динамики. Результаты. Создан новый метод определения иерархии доменов на основе данных молекулярной динамики, получивший название иерархического доменного выравнивания (HDWA).

 

Ключевые слова: динамические домены, идентификация доменов, иерархическое доменное выравнивание, молекулярная динамика.

 

Summary in English

 

Summary in Ukrainian