Дослідження впливу іонних взаємодій на конформацію рибозиму, специфічного до tat-РНК BIЛ-1, у розчині методом часткового нуклеазного гідролізу
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000627Анотація
Методом часткового нуклеазного гидролізу показано, що іонний склад середовища суттєво впливає на третинні взаємодії в молекулі рибозиму, змінюючи його просторову структуру.Посилання
Jackson WH Jr, Moscoso H, Nechtman JF, Galileo DS, Garver FA, Lanclos KD. Inhibition of HIV-1 replication by an anti-tat hammerhead ribozyme. Biochem Biophys Res Commun. 1998;245(1):81-4.
Michienzi A, Conti L, Varano B, Prislei S, Gessani S, Bozzoni I. Inhibition of human immunodeficiency virus type 1 replication by nuclear chimeric anti-HIV ribozymes in a human T lymphoblastoid cell line. Hum Gene Ther. 1998;9(5):621-8.
Trang P, Lee M, Nepomuceno E, Kim J, Zhu H, Liu F. Effective inhibition of human cytomegalovirus gene expression and replication by a ribozyme derived from the catalytic RNA subunit of RNase P from Escherichia coli. Proc Natl Acad Sci U S A. 2000;97(11):5812-7.
Michienzi A, Cagnon L, Bahner I, Rossi JJ. Ribozyme-mediated inhibition of HIV 1 suggests nucleolar trafficking of HIV-1 RNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 2000;97(16):8955-60.
Zhang Y, Leibowitz MJ. Folding of the group I intron ribozyme from the 26S rRNA gene of Candida albicans. Nucleic Acids Res. 2001;29(12):2644-53.
Wang YX, Lu M, Draper DE. Specific ammonium ion requirement for functional ribosomal RNA tertiary structure. Biochemistry. 1993;32(46):12279-82.
Buryanovsky LN. Effect of pH, ionic strength, and ionic composition on efficiency of hammerhead ribozyme-mediated cleavage of the tat-RNA HIV-I in vitro. Biopolym Cell. 1997; 13(1):30-5.
Markelova OYu, Buryanovsky LM, Kitam OE, Krasnova KF, Shved AD. Effect of medium ionic composition on cleavage activity and formation of complex between hammerhead ribozyme and short HIV-1 taf-RNA. Biopolym Cell. 2002; 18(4):301-6.
Heus HA, Uhlenbeck OC, Pardi A. Sequence-dependent structural variations of hammerhead RNA enzymes. Nucleic Acids Res. 1990;18(5):1103-8.
Woisard A, Fourrey JL, Favre A. Multiple folded conformations of a hammerhead ribozyme domain under cleavage conditions. J Mol Biol. 1994;239(3):366-70.
