Biopolym. Cell. 1992; 8(3):23-29.
Структура и функции биополимеров
Обнаружение pUC19-гомологичных повторяющихся последовательностей в геноме некоторых видов высших растений
1Пацковский Ю. В., 1Гайдук В. В., 1Веселовский О. В., 2Зубко Е. И., 2Пастернак Т. П., 1Юркевич Л. Н., 2Машталер С. Г., 1Потопальский А. И.
  1. Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины
    ул. Академика Заболотного, 150, Киев, Украина, 03680
  2. Институт клеточной биологии и генетической инженерии НАН Украины
    ул. Академика Заболотного, 148, Киев, Украина, 03680

Abstract

Методом блот-гцбридизации по Саузерну изучали наличие и организацию повторяющих- ся последовательностей, гомологичных ДНК плазмиды pUC19, в геноме некоторых видов высших растений семейства злаковых (рожь, кукуруза, пшеница) и пасленовых (паслен, табак, красавка, картофель). Часто повторяющиеся pUC-гомологичные последовательности обнаружены в составе ядерной ДНК ржи (две линии, полученные из cорта Житомирская), пшеницы (сорт Сибирская 18), паслена (одна линия из трех), красавки. pUC-повторы присутствуют в виде нескольких сотен или тысяч копий на -геном в составе ДНК картофеля (сорт Зарево), томатов (сорт К-139), кукурузы (две линии сорта PLS-72). Показано, что pUC-гомологичные последовательности могут быть использованы в качестве маркера при анализе соматических гибридов красавка+табак. Найдены различия в числе и организации pUC-повторов в составе геномов разных .поколений (F2 и F4) двух линий ржи. Предполагается, что внутри-и межвидовой полиморфизм числа или организации pUС-гомологичных последовательностей может быть обусловлен нестабильностью генома растений.

References

[1] Il'in IuV. Repeated genes in eukaryotes. Mol Biol (Mosk). 1982;16(2):229-57.
[2] Koukalov? B, Reich J, Maty??ek R, Kuhrov? V, Bezd?k M. A BamHI family of highly repeated DNA sequences of Nicotiana tabacum. Theor Appl Genet. 1989;78(1):77-80.
[3] Ganal MW, Lapitan NLV, Tanksley SD. A molecular and cytogenetic survey of major repeated DNA sequences in tomato (Lycopersicon esculentum). Mol Gen Genet. 1988;213(2-3):262–8.
[4] Zamir D, Tanksley SD. Tomato genome is comprised largely of fast-evolving, low copy-number sequences. Mol Gen Genet. 1988;213(2-3):254–61.
[5] Simoens CR, Gielen J, Van Montagu M, Inz? D. Characterization of highly repetitive sequences of Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res. 1988;16(14B):6753-66.
[6] Jones JDG, Flavell RB. The mapping of highly-repeated DNA families and their relationship to C-bands in chromosomes of Secale cereale. Chromosoma. 1982;86(5):595–612.
[7] Appels R, Moran LB, Gustavson JP. The structure of DNA from the rye (Secale cereale) NORRI locus and its behavior in wheat backgrounds. Can J Genet Cytol. 1986; 28(2): 673-85.
[8] Ranade SA, Lagu MD, Patankar SM, Dabak MM, Dhar MS, Gupta VS, Ranjekar PK. Identification of a dispersed MboI repeat family in five higher plant genomes. Biosci Rep. 1988;8(5):435-41.
[9] Deumling B. Sequence arrangement of a highly methylated satellite DNA of a plant, Scilla: A tandemly repeated inverted repeat. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78(1):338-42.
[10] Kato A, Yakura K, Tanifuji S. Sequence analysis of Vicia faba repeated DNA, the FokI repeat element. Nucleic Acids Res. 1984;12(16):6415-26.
[11] Zimmerman PA, Lang-Unnasch N, Cullis CA. Polymorphic regions in plant genomes detected by an M13 probe. Genome. 1989;32(5):824–8.
[12] Zubko MK, Zubko EI, Kapranov PhV. Induction of chlorophyll deficient tobacco mutants as markers for cell engineering. Biopolym Cell. 1991;7(4):72-9.
[13] Vlas?k J. Effect of different disintegration techniques and media on yield and appearance of isolated nuclei. Biol Plan. 1981;23(6):406–13.
[14] Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
[15] Westneat DF, Noon WA, Reeve HK, Aquadro CF. Improved hybridization conditions for DNA 'fingerprints' probed with M13. Nucleic Acids Res. 1988;16(9):4161.