Biopolym. Cell. 2016; 32(3):235-241.
Вирусы и клетка
Определение штаммовый принадлежности украинских изолятов вируса желтой мозаики цуккини и их распространение на территории Украины
1, 2Цвигун В. А., 2Руднева Т. А., 1Шевченко Т. П., 1Будзанивская И. Г., 1Полищук В. П.
  1. Учебно-научный центр «Институт биологии»
    Киевского национального университета имени Тараса Шевченко
    ул. Владимирская, 64/13, Киев, Украина, 01601
  2. Институт агроэкологии и природопользования НААН Украины
    ул. Метрологическая 12, Киев, Украина, 03680

Abstract

Цель. Определить штаммовую принадлежность украинской изолятов вируса желтой мозаики цуккини и исследовать их распространение на территории Украины. Методы. В работе были использованы следующие методы: визуальная диагностика, иммуноферментный анализ, ОТ-ПЦР, сиквенирование и филогенетический анализ. Результаты. Проверены растения семейства Cucurbitaceae на наличие антигенов вируса желтой мозаики цуккини (ВЖМЦ). Установлено, что 41 % проверенных растений семейства Cucurbitaceae поражен вирусом желтой мозаики цуккини. Вирусинфицированные растения имелись в агроценозах Винницкой, Запорожской, Киевской, Полтавской и Черкасской областей. В результате проведения ОТ-ПЦР были получены продукты амплификации размером 605 п.о., что соответствует по размеру участку генома, кодирующему Nib/CP вируса желтой мозаики цуккини. По результатам данных секвенирования построили филогенетическое дерево выделенных изолятов ZYMV. Выводы. Идентификация инфицированных растений в 5 из 9 обследуемых агроценозов показала широкое распространение ZYMV в Украине. Топология филогенетического дерева показывает, что изоляты ZYMV формируют три группы. Филогенетическая позиция на этом дереве изолятов ZYMV показывает их принадлежность к группе А подгруппы 1. Эта группа является наиболее многочисленной и ее представители имеют широкое географическое распространение. Данные изоляты ZYMV оказались близкородственными между собой. Процент идентичности между ними находился в диапазоне от 99,7 до 100. Изоляты ZYMV, циркулирующие в Украине, имеют общее происхождение с европейскими изолятами из Австрии (AJ420017), Словении (AJ420018), Сербии (HM072432), Венгрии (AJ459955), Словакии (DQ124239). Процент идентичности между украинскими и европейскими изолятами находится в пределах от 94,3 до 100.
Keywords: вирус желтой мозаики цуккини, агроценозы, штаммы, филогенетический анализ

References

[1] Desbiez C, Lecoq H. Zucchini yellow mosaic virus. Plant Pathol. 1997; 46(6):809–29.
[2] Fauquet C, Mayo MA, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA. Virus taxonomy. VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Academic Press, 2004. 1162 p.
[3] Gal-On A. Zucchini yellow mosaic virus: insect transmission and pathogenicity -the tails of two proteins. Mol Plant Pathol. 2007;8(2):139-50.
[4] Rudneva TO, Shevchenko TP, Boyko AL. Vlastyvosti virusu zhovtoi mozaiky cukkini, izolovanogo z roslyn rodyny Cucurbitaceae. Agroekologichnyy Zhurnal. 2008. Sp ed:205-7.
[5] Desbiez C, Wipf-Scheibel C, Lecoq H. Biological and serological variability, evolution and molecular epidemiology of Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV, Potyvirus) with special reference to Caribbean islands. Virus Res. 2002;85(1):5-16.
[6] Yakoubi S, Desbiez C, Fakhfakh H, Wipf-Scheibel C, FabreF, Pitrat M, Marrakchi M, Lecoq H. Molecular, biological and serological variability of Zucchini yellow mosaic virus in Tunisia. Plant Pathol. 2008;57(6):1146-54
[7] Polischuk VP, Budzanivska IG, Shevchenko TP. Posibnyk praktychnyh zanyatt do kursu «Zagalna Virusologia». Kyiv: "Fotosociotsentr", 2005; 129-133.
[8] Antibodies. A practical approach. Ed Catty D. IRL Press, 1989; 280 p.
[9] Gnutova RV. Serologia i immunokhimia virusov rasteniy. M.: Nauka, 1993. 301 p.
[10] QIAGENR. One step RT-PCR Kit Handbook. Quiagen, 2002. 39p.
[11] Safaeizadeh M. Comparative biological and molecular variability of Zucchini yellow mosaic virus in Iran. Asian J Plant Pathol. 2008; 2(1):30-9.
[12] Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol Biol Evol. 2013;30(12):2725-9.