Про деякі закономірності в організації просторової структури білків
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000344Анотація
Проаналізовано головні труднощі у передбаченні структури білків за гомологією послідовностей і проведено попередній аналіз інформаційних сайтів білків. Виявлено, що як для гомо-, так і для гетерогенних повторених блоків амінокислот інформаційно значущою є певна множина залишків. Запропоновано і обговорено деякі принципи і закономірності організації просторової структури білків.Посилання
Garnier J, Levin JM. The protein structure code: what is its present status? Comput Appl Biosci. 1991;7(2):133-42. Review.
Maltchenko SZ, Chaschin NA. Prediction of protein secondary structures. Biopolym Cell. 1992; 8(5):21-31.
Kabsch W, Sander C. On the use of sequence homologies to predict protein structure: identical pentapeptides can have completely different conformations. Proc Natl Acad Sci U S A. 1984;81(4):1075-8.
Shaw GS, Hodges RS, Sykes BD. Calcium-induced peptide association to form an intact protein domain: 1H NMR structural evidence. Science. 1990;249(4966):280-3.
Sternberg MJ, Islam SA. Local protein sequence similarity does not imply a structural relationship. Protein Eng. 1990;4(2):125-31.
Corpet F. Multiple sequence alignment with hierarchical clustering. Nucleic Acids Res. 1988;16(22):10881-90.
Troitsky GV. Defective proteins: postsynthetic modification. Kiev: Naukova Dumka, 1991. 232 p.