Спроба поєднати морфологічні ознаки та послідовності ядерної рибосомної ДНК (внутрішнього транскрибованого спейсера) в філогенетичних дослідженнях у роді Nicotiana
DOI:
https://doi.org/10.7124/bc.000534Анотація
Досліджено родинні зв'язки 24 видів роду Nicotiana на основі первинної структури внутрішнього транскрибованого спейсера ядерної рибосомної ДНК згідно з методом «максимальної економії». Здійснено їхнє порівняння з даними повного морфологічного аналізу, морфології насіннєвих оболонок та поліпептидного складу рубіско цих видів. Зроблено висновок стосовно того, що недостатньо покладатися лише на морфологічні або молекулярні дані при реконструкції філогенії будь-якого таксону.Посилання
Henning W. Phylogenetic Systematics, Urbana: Univ. of Illinois press1966 p. 435.
Burbidge N.T. The australian species of Nicotiana L (Solanaceae). Aust. J. Bot, 1960; 8(3):342-395.
Goodspeed T.H. The Genus Niconiana, Massachusetts: Waltham 1954 p. 536.
Merxmuller J., Buttler K.P. Nicotiana in Africanischen Namiberi Pflanzengeographischen and Phylogenetischen Ratsel. Mitt. Bot. Munchen, 1975 12, pp. 91-104.
Murashige T, Skoog F. A revised medium for rapid growth and bio assays with tobacco tissue cultures. Physiol Plant. 1962;15(3):473–97.
Narayan R.K.J. Nuclear DNA changes, genome differentiation and evolution in Nicotiana (Solanaceae. Plant Systematics and Evolution, 1987; 157(3-4): 161-180.
Ingle J, Timmis JN, Sinclair J. The Relationship between Satellite Deoxyribonucleic Acid, Ribosomal Ribonucleic Acid Gene Redundancy, and Genome Size in Plants. Plant Physiol. 1975;55(3):496-501.
Long EO, Dawid IB. Repeated genes in eukaryotes. Annu Rev Biochem. 1980;49:727-64.
Baldwin BG. Phylogenetic utility of the internal transcribed spacers of nuclear ribosomal DNA in plants: an example from the compositae. Mol Phylogenet Evol. 1992;1(1):3-16.
Hsiao C, Chatterton NJ, Asay KH, Jensen KB. Molecular phylogeny of the Pooideae (Poaceae) based on nuclear rDNA (ITS) sequences. Theor Appl Genet. 1995;90(3-4):389-98.
Soltis D.E., Kuzoff R.K. Discordance between nuclear and chloroplast phylogenies in the Heuchera group (Saxifragaceae). Evolution, 1995; 49 (4):727-742.
Suh Y., Thien L.V., Raeve H.E., Zimmer E.A. Molecular evolution and phylogenetic implications of internal transcribed spacer sequences of ribosomal DNA in Winteraceae. Amer. J. Bot, 1993; 80:1042-1055.
Sun Y., Skinner D.Z., Liang G.H., Hulbert S.H. Phylogenetic analysis of Sorghum and related taxa using internal transcribed spacers of nuclear ribosomal DNA. Theoretical and Applied Genetics,1994; 89 (1):26-32.
Wojciechowski M.F., Sanderson M.J., Baldwin B.G., Donoghue M.J. Monophyly of aneuploid astragalus (Fabaceae): Evidence from nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer sequences. Amer. J. Bot, 1993 80:711-722.
Arnheim, N. Concerted evolution of multigene families. Evolution of Genes and Proteins, Eds R. Koehn, M. Nei. Sinauer: Sanderland 1983; 38-61.
Dover G. Molecular drive: a cohesive mode of species evolution. Nature. 1982;299(5879):111-7.
Palmer J.D., Jensen R.K., Michaels H.J., Chase M.W., Manhart J.R. Chloroplast DNA variation and plant phylogeny. Annu. Mo. Bot. Gard, 1975; 1180-1206.
Systma J.J., Smith J.F., Gottlieb L.D. Phylogenetics in Clarkia (Onagraceae): Restriction site mapping of chloroplast DNA. Syst. Biol, 1915 : 280-295.
Chaplin J.F., Burk L.G. Plant Propagation, Nicotiana: procedures for experimental use. Technical bulletin 1586, US Department of Agriculture. New York 1979;. 28-32.
Murray MG, Thompson WF. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acids Res. 1980;8(19):4321-5.
White T.J., Bruns T., Lee S., Taylor J. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications,San Diego: Acad, press 1990: 315-322.
Higgins DG, Bleasby AJ, Fuchs R. CLUSTAL V: improved software for multiple sequence alignment. Comput Appl Biosci. 1992;8(2):189-91.
Kluge A. G., Farris J. S. Quantitative phyletics and the evolution of anurans Systematic Zool. 1969; 18(1):1—32.
Felsenstein J. PHYLIP—Phylogeny Inference Package, Version 3.5 1993.
Felsenstein J. Confidence limits on phytogenies: An approach using bootstrap Evolution; 1985. 39(4):783—791.
Sanderson M. J. Confidence limits on phylogenies: the bootstrap revised. Cladistics. 1989. 5: 113—129.
Wu C. F. J. Jackknife, bootstrap and other resampling plans in regression analysis Ann. of Statistics. 1986. 14.:1261—1295.
Jorgensen R. A., Cluster P. D. Models and tempos in the evolution of nuclear liposomal DNA: new characters for evolutionary studies and new markers for genetic and population studies Amer. Missuor. Bot. Gard. 1988. 75:1238—1247.
Takaiwa F., Oono K., Sugiura M. Nucleotide sequence of the 17—25S spacer region from rice rDNA Plant. Mol. Biol. 1985. 4: 355—364.
Bahadur B., Farooqui S. M. Seed and seed coat characters in australian Nicotiana II Solanaceae. Biology and systematics Ed. W. G. D'Arcy. New York: Columbia Univ. press, 1986; 114—137.
Chen 1C, Johal S.t Wildman S. G. Role of chloroplast and nuclear DNA genes during evolution of fraction I protein Genetic and biogenesis of chloroplast and mitochondria. Amsterdam: Elsevier, 1976. 3—11.
