Biopolym. Cell. 1992; 8(4):20-30.
Структура и функции биополимеров
Синтез дипептидов, содержащих мета- и пара-фторфенилаланин. Разделение на оптические изомеры и изучение их реакционной способности в отношении тромбина
1Пояркова С. А., 1Кухарь В. П., 1Колычева М. Т., 1Храпунов С. Н., 1Драган А. И.
  1. Институт биоорганической химии и нефтехимии НАН Украины
    ул. Мурманская, 1, Киев, Украина, 02094

Abstract

Из рацемата тозил-м- и тозил-п-фторфенилаланина синтезирована серия оптически активных дипептидов общей формулы: Tos-X-Arg-OCH3, где X = D-Phe(mF), L-Phe(mF), D-Phe(pF), L-Phe(pF). Исследование спектров поглощения и разностных спектров флюоресценции выявило ряд отличий, обусловленных конформационной подвижностью DL- и LL-изомеров. Батохромный сдвиг спектров поглощения и флюоресценции дипептидов с м-фторфенилаланином отличается от такового дипептида, содержащего п-фторфенилаланин. Изучение кинетики гидролиза синтезированных соединений тромбином показало, что субстраты содержащие D-изомеры фторфенилаланина, ферментом не расщепляются. Дипептид, содержащий L-изомер п-фторфениланина, обладает биорегуляторным эффектом, в то время как дипептид, содержащий L-изомер м-фторфенилаланина, этим эффектом не обладает. Обсуждается связь между конформационной подвижностью пептидов и их субстратными характеристиками, а также роль π–π-взаимодействий при образовании фермент-субстратного комплекса.

References

[1] Fenton JW, Landis BH, Walz DA et al. Human thrombin: Preparative, evolution, structural properties, and enzymic specificity. Chem. and physiol. of human plasma proteins. Ed. D. H. Bing. New York : Pergamon press, 1979: 151-73.
[2] Fenton JW 2nd. Thrombin specificity. Ann N Y Acad Sci. 1981;370:468-95.
[3] Liem RKH, Scheraga HA. Mechanism of action of thrombin on fibrinogen. III. Partial mapping of the active sites of thrombin and trypsin. Arch Biochem Biophys. 1973;158(1):387–95.
[4] Meinwald YC, Martinelli RA, van Nispen JW, Scheraga HA. Mechanism of action of thrombin on fibrinogen. Size of the A alpha fibrinogen-like peptide that contacts the active site of thrombin. Biochemistry. 1980;19(16):3820-5.
[5] Liem RKH, Scheraga HA. Mechanism of action of thrombin on fibrinogen. IV. Further mapping of the active site of thrombin and trypsin. Arch Biochem Biophys 1974;160(1):333–9.
[6] Pozsgay M, Szab? G, Bajusz S, Simonsson R, G?sp?r R, El?di P. Study of the specificity of thrombin with tripeptidyl-p-nitroanilide substrates. Eur J Biochem. 1981;115(3):491-5.
[7] Bajusz S, Barab?s E, Tolnay P, Sz?ll E, Bagdy D. Inhibition of thrombin and trypsin by tripeptide aldehydes. Int J Pept Protein Res. 1978;12(4):217-21.
[8] Fenton JW 2nd. Regulation of thrombin generation and functions. Semin Thromb Hemost. 1988;14(3):234-40.
[9] Poiarkova SA, Kibirev VK, Serebriany? SB. Inhibitory effect of methyl esters of arginine-containing oligopeptides on thrombin and trypsin. Ukr Biokhim Zh. 1987;59(5):5-11.
[10] Poiarkova SA, Kibirev NK, Serebriany? SB. Inhibition of the proteolytic activity of thrombin by methyl esters of arginine-containing oligopeptides. Ukr Biokhim Zh. 1986;58(6):3-8.
[11] Klesov AA, Berezin IV. Use of integrated rate equations for the determination of the kinetic constants of enzyme reactions. Biokhimiia. 1972;37(1):170-83.
[12] Bode W, Mayr I, Baumann U, Huber R, Stone SR, Hofsteenge J. The refined 1.9 A crystal structure of human alpha-thrombin: interaction with D-Phe-Pro-Arg chloromethylketone and significance of the Tyr-Pro-Pro-Trp insertion segment. EMBO J. 1989;8(11):3467-75.
[13] Bakhshiev NG. Spectroscopy of intermolecular interactions. Leningrad: Nauka, 1972. 265 p.
[14] Sverdlov OV. Electronic spectra in organic chemistry. Khimiya, 1973. 248 p.
[15] Lakowicz JR, Principles of Fluorescence Spectroscopy. Plenum Press, New York, London, 1983.
[16] Strukova SM, Semenova OA, Kireeva EG. Regulation of alpha and beta/gamma-thrombin activity by heparin and indole. Biokhimiia. 1980;45(4):738-46.