Biopolym. Cell. 1990; 6(6):52-58.
Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
1Лукина Н. И., 2Сойдла Т. Р.
  1. Ленинградский политехнической институт
    Ленинград, СССР
  2. Ленинградcкий институт ядерной физики им. Б. П. Константинова АН СССР
    Гатчина, Ленинградcкая обл., СССР

Abstract

Созданы две программы для выявления и визуализации пространственной асимметрии ДНК. С их помощью анализировали 2 мкм плазмиду дрожжей-сахаромицетов. Выявлен участок особой ориентации G—С-пар. Расположение этого участка совпадает с локализацией ненуклеосомного ДНК-белкового комплекса, выявленного ранее в экспериментальной работе. Созданные программы могут быть использованы для поиска крупных ДНК-белковых комплексов.

References

[1] Johnson PF, McKnight SL. Eukaryotic Transcriptional Regulatory Proteins. Annu Rev Biochem. 1989;58(1):799–839.
[2] Saenger W. Principles of nucleic acid structure. New York: Springer, 1984; 556 p.
[3] Goulet I, Zivanovic Y, Prunell A. Helical repeat of DNA in solution. The V curve method. Nucleic Acids Res. 1987;15(7):2803-21.
[4] Satchwell SC, Drew HR, Travers AA. Sequence periodicities in chicken nucleosome core DNA. J Mol Biol. 1986;191(4):659-75.
[5] Hartley JL, Donelson JE. Nucleotide sequence of the yeast plasmid. Nature. 1980;286(5776):860-5.
[6] So?dla TR, Nevzgliadova OV. A 2-um plasmid of Saccharomyces. Mol Biol (Mosk). 1987;21(6):1467-79.
[7] Murray JA, Cesareni G. Functional analysis of the yeast plasmid partition locus STB. EMBO J. 1986;5(12):3391-9.
[8] Fagrelius TJ, Livingston DM. Location of DNAase I sensitive cleavage sites in the yeast 2 micron plasmid DNA chromosome. J Mol Biol. 1984;173(1):1-13.
[9] Veit BE, Fangman WL. Chromatin organization of the Saccharomyces cerevisiae 2 microns plasmid depends on plasmid-encoded products. Mol Cell Biol. 1985;5(9):2190-6.
[10] Ptashne M. Gene regulation by proteins acting nearby and at a distance. Nature. 1986 Aug 21-27;322(6081):697-701.