Biopolym. Cell. 2015; 31(1):57-62.
Вирусы и клетка
Первое сообщение о детекции изолятов подгруппы IB вируса мозаики огурца в Украине
1Шевченко Т. П., 1Тымчишин О. В., 1Аль Далаин Е., 1Бысов А. С., 1Будзанивская И. Г., 1Шевченко А. В., 1Полищук В. П.
  1. Учебно-научный центр «Институт биологии»
    Киевского национального университета имени Тараса Шевченко
    ул. Владимирская, 64/13, Киев, Украина, 01601

Abstract

Цель. Установить штаммовую принадлежности украинских изолятов вируса мозаики огурца (ВМО) на основании филогенетичного анализа частичной последовательности гена капсидного белка. Методы. Иммуноферментный анализ (ИФА), полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), секвенирование ДНК и филогенетический анализ. Результаты. ВМО широко распространён в Украине среди сельскохозяйственных культур. Были отобраны и проанализированы образцы растений с вирусоподобными симптомами семейств Cucurbitaceae и Solanaceae. На основе визуальной и серологической диагностики два образца Lycopersicon esculentum и Cucurbita pepo из Полтавской области были избраны для дальнейших молекулярных исследований. Были амплифицированы и секвенированы частичные последовательности гена капсидного белка. Проведено сравнение полученных последовательностей кДНК гена капсидного белка этих изолятов с опубликованными в Генбанке последовательностями штам­мов ВМО различных подгрупп. Наибольшая гомология украинских изолятов продемонстрирована с представителями подгруппы ІВ. Наиболее родственными к украинским изолятам показаны штаммы АВІ (Корея) и SD (Китай). Выводы. Исходя из результатов филогенетического анализа, украинские изоляты ВОМ принадлежат к подгруппе ІВ. Результаты этой работы являются первым свидетельством присутствия изолятов подгруппы ІВ ВМО на территории Украины.
Keywords: вирус мозаики огурца, ген кап­сид­ного белка, филогенетический анализ

References

[1] Arafati N, Farzadfar S, Pourrahim R. Characterization of coat protein gene of Cucumber mosaic virus isolates in Iran. Iran J Biotech. 2013;11(2):109-14.
[2] Roossinck MJ. Evolutionary history of Cucumber mosaic virus deduced by phylogenetic analyses. J Virol. 2002;76(7):3382-7.
[3] Palukaitis P, Garc?a-Arenal F. Cucumoviruses. Adv Virus Res. 2003;62:241-323.
[4] Brigneti G, Voinnet O, Li WX, Ji LH, Ding SW, Baulcombe DC. Viral pathogenicity determinants are suppressors of transgene silencing in Nicotiana benthamiana. EMBO J. 1998;17(22):6739-46.
[5] Ng JC, Perry KL. Transmission of plant viruses by aphid vectors. Mol Plant Pathol. 2004;5(5):505-11.
[6] Suzuki M, Kuwata S, Masuta C, Takanami Y. Point mutations in the coat protein of cucumber mosaic virus affect symptom expression and virion accumulation in tobacco. J Gen Virol. 1995;76 ( Pt 7):1791-9.
[7] Palukaitis P, Roossinck MJ, Dietzgen RG, Francki RI. Cucumber mosaic virus. Adv Virus Res. 1992;41:281-348.
[8] Roossinck MJ, Zhang L, Hellwald KH. Rearrangements in the 5' nontranslated region and phylogenetic analyses of cucumber mosaic virus RNA 3 indicate radial evolution of three subgroups. J Virol. 1999;73(8):6752-8.
[9] Sclavounos AP, Voloudakis AE, Arabatzis Ch, Kyriakopoulou PE. A severe hellenic CMV tomato isolate: symptom va­riability in tobacco, characterization and discrimination of variants. Eur J Plant Pathol. 2006; 115(2): 163–72.
[10] Zitikait? I, Staniulis J, Urbanavi?ien? L, ?i?yt? M. Cucu­m­ber mosaic virus identification in pumpkin plants. ?em­dir­byst?. 2011; 98(4):421-6.
[11] Crowther JR. ELISA. Theory and practice. Methods Mol Biol. 1995;42:1-218.
[12] Bariana HS, Shannon AL, Chu PW, Waterhouse PM. De­te­ction of five seedborne legume viruses in one sensitive multiplex polymerase chain reaction test. Phytopathology. 1994; 84(10): 1201-5.
[13] Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol. 1980;16(2):111-20.
[14] Kumari R, Bhardwaj P, Singh L, Zaidi AA, Hallan V. Biological and Molecular Characterization of Cucumber mosaic virus Subgroup II Isolate Causing Severe Mosaic in Cucumber. Indian J Virol. 2013;24(1):27-34.
[15] Nematollahi S, Sokhandan-Bashir N, Rakhshandehroo F, Zamanizadeh HR. Phylogenetic analysis of new isolates of Cucumber mosaic virus from Iran on the basis of different genomic regions. Plant Pathol J. 2012; 28(4):381-9.