Biopolym. Cell. 2005; 21(2):145-150.
Геном и его регуляция
Определение размера ядерного генома и кариотипический анализ видов Papaver для создания ВАС библиотеки
1Кириленко Т. К., 1Мартиненко Е. И., 1Алхимова Е. Г.
  1. Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины
    ул. Академика Заболотного, 150, Киев, Украина, 03680

Abstract

Робота посвящена изучению пути биосинтеза алкалоидов у видов Papaver и интегрированию данных по физическому картированию новых маркерных последовательностей ДНК с различиями в экспрессии генов ключевых ферментов биосинте­за алкалоидов. Такое исследование нуждается в знании струк­туры генома и его организации, а также предполагает наличие геномных ресурсов для детального анализа генома опийного мака. В данном сообщении определен размер генома опийного мака и сделан кариотипический анализ Papaver somniferum и его родственных видов, P. bracteatum и P. rhoeas. Полученные характеристики необходимы для создания ВАС библиотеки, предоставляющей базис для цитогенетического картирования и поиска изменений кариотипа у линий мака, различающихся путями биосинтеза алкалоидов. Уже выделены несколько кле­точных линий, накапливающих разные типы алкалоидов.
Keywords: Papaver, алкалоиды, размер генома, ВАС библиотека, флуоресцентная гибридизация in situ

References

[1] Facchini PJ, De Luca V. Phloem-Specific Expression of Tyrosine/Dopa Decarboxylase Genes and the Biosynthesis of Isoquinoline Alkaloids in Opium Poppy. Plant Cell. 1995;7(11):1811-1821.
[2] Bird DA, Franceschi VR, Facchini PJ. A tale of three cell types: alkaloid biosynthesis is localized to sieve elements in opium poppy. Plant Cell. 2003;15(11):2626-35.
[3] Facchini PJ, De Luca V. Differential and tissue-specific expression of a gene family for tyrosine/dopa decarboxylase in opium poppy. J Biol Chem. 1994;269(43):26684-90.
[4] De Luca V, St Pierre B. The cell and developmental biology of alkaloid biosynthesis. Trends Plant Sci. 2000;5(4):168-73.
[5] Gindullis F, Dechyeva D, Schmidt T. Construction and characterization of a BAC library for the molecular dissection of a single wild beet centromere and sugar beet (Beta vulgaris) genome analysis. Genome. 2001;44(5):846-55.
[6] M?ller SG, Chua NH. Chemical regulated production of cDNAs from genomic DNA fragments in plants. Plant J. 2002;32(4):615-22.
[7] Ausubel FM, Brent R, Kingston RE, Moore DD, Seidman JG, Smith JA, Struhl K. Current protocols in molecular biology. New York: Greene. Wiley Int., 1987; 418 p.
[8] Dolezcaronel J, Greilhuber J, Lucretti S, Meister A, Lysak MA, Nardi L, et al. Plant Genome Size Estimation by Flow Cytometry: Inter-laboratory Comparison. Ann Bot. 1998;82(suppl 1):17–26.
[9] Gerlach WL, Bedbrook JR. Cloning and characterization of ribosomal RNA genes from wheat and barley. Nucleic Acids Res. 1979;7(7):1869-85.
[10] Alkhimova AG, Heslop-Harrison JS, Shchapova AI, Vershinin AV. Rye chromosome variability in wheat-rye addition and substitution lines. Chromosome Res. 1999;7(3):205-12.
[11] Dolezel J, Bartos J, Voglmayr H, Greilhuber J. Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry A. 2003;51(2):127-8.
[12] Srivastava S, Lavania UC. Evolutionary DNA variation in Papaver. Genome . 1991;34(5):763–8.
[13] Heslop-Harrison JS, Schwarzacher T, Anamthawat-Jonsson K. In situ hybridization with automated chromosome denaturation. Technique. 1991; 3: 109-116.
[14] Kyrylenko TK, Martynenko OI, Alkhimova OG. Organspecific expression of tyrosine. dopa genes and the biosynthesis of isoquinoline alkaloids in Papaver sp. Ukr Biokhim Zh. 2002; 74(4b suppl 2): 35.