Biopolym. Cell. 2002; 18(2):124-130.
Анализ наборов праймеров для детекции провирусной ДНК вируса лейкоза крупного рогатого скота и вируса иммунодефицита человека с помощью полимеразной цепной реакции
1, 2Лиманский А. П., 2Лиманская О. Ю.
  1. Институт микробиологии и иммунологии им. И. И. Мечникова НАМН
    ул. Пушкинская, 14, Харьков, Украина, 61057
  2. Институт экспериментальной и клинической ветеринарной медицины УААН
    ул. Пушкинская, 83, Харьков, Украина, 61023

Abstract

Проведено теоретическое и экспериментальное сравнение четырех наборов праймеров для детекции провирусной ДНК вируса лейкоза крупного рогатого скота (ВЛ КРС) с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР). Продемонстрировано, что праймеры со 100 %-й степенью гомологии для всех известных изолятов ВЛ КРС позволили выявить большее количество вирусоносителей, чем праймеры с меньшим уров­нем гомологии, которые имеют по 2–4 ошибочных (неспаренных) нуклеотида. Сформулированы основные положения про­граммы по безвакцинному искоренению ВЛ КРС в Украине. Показано, что праймеры из коммерческого набора для ПЦР- детекции вируса иммунодефицита человека 1-го типа имеют 5–7 ошибочных нуклеотидов, что может существенно сни­жать качество ПЦР-диагностикума.

References

[1] Grant KA, Kroll RG. Molecular biology techniques for the rapid detection and characterization of food borne bacteria. Food Sci Technol. Today. 1993; 7(2): 80-5.
[2] Tougianidou D. Use of PCR for the routine detection of viruses in drinking water and bathing water. Zentralbl Hyg Umweltmed. 1993; 194(5-6):440.
[3] Schlunk B, Rziha HJ. Detection of foodborne viruses by the polymerase chain reaction. Rev Med Vet. 1994; 145(3): 215-6.
[4] Pusk?s LG, Fartmann B, Bottka S. Restricted PCR: amplification of an individual sequence flanked by a highly repetitive element from total human DNA. Nucleic Acids Res. 1994;22(15):3251-2.
[5] Gopalkrishna V, Srivastava AN, Hedau S, Sharma JK, Das BC. Detection of human papillomavirus DNA sequences in cancer of the urinary bladder by in situ hybridisation and polymerase chain reaction. Genitourin Med. 1995;71(4):231-3.
[6] Ryskov AP, Gordon IO. DNA polymorphism and DNA fingerprinting. Biotekhnologiia. 1992;(3):3-11 .
[7] Brodsky LI, Drachev AL, Tatuzov RL, Chumakov KM. QenBee: a package of programs for biopolymers sequence analysis. Biopolym Cell. 1991; 7(1):10-14.
[8] Rychlik W, Spencer WJ, Rhoads RE. Optimization of the annealing temperature for DNA amplification in vitro. Nucleic Acids Res. 1990;18(21):6409-12.
[9] Limanskaya OYu, Limanskiy AP, Nekhoroshikh YeM, Busol VA, Tsymbal VI. Detection of bovine leukemia virus by polymerase chain reaction. Vistnyk Agrarnoi Nauky. 1999; 9: 35-9.
[10] Limanskaya OYu, Limanskiy AP, Bezuglyy ID. Sexing preimplantation embryos of farm animals by polymerase chain reaction. Biotekhnlogiia. 2000; 2: 66-72.
[11] Klintevall K, Ballagi-Pord?ny A, N?slund K, Bel?k S. Bovine leukaemia virus: rapid detection of proviral DNA by nested PCR in blood and organs of experimentally infected calves. Vet Microbiol. 1994;42(2-3):191-204.
[12] Eaves FW, Molloy JB, Dimmock CK, Eaves LE. A field evaluation of the polymerase chain reaction procedure for the detection of bovine leukaemia virus proviral DNA in cattle. Vet Microbiol. 1994;39(3-4):313-21.
[13] Beier D, Blankenstein P, Marquardt O, Kuzmak J. Identification of different BLV provirus isolates by PCR, RELPA and DNA sequencing. Berl Munch Tierarztl. Wschr. 2001; 114:252-6.
[14] Kovalyushko V. To retreated leukemia. Vet Med Ukr. 1996;5:9-11.
[15] Syurin VYa, Samuylenko AYa, Solov'ev BF, Fomina IV. Viral diseases of animals. M.: VNITIBP, 1998. 928 p.