Цель. Установление закономерностей в локализации динуклеотидов 5'-CG-3' и тринуклеотидов 5'- CNG-3' в последовательностях микроРНК (miRNA). Методы. Биоинформатический и ста- тистический анализ последовательностей зрелых miRNA. Результаты. Один из наиболее высоких пиков концентрации сайта 5'-CG-3' локализуется в месте расположения нуклеотида 10 с 5'-конца miRNA. Уровень концентрации сайта 5'-CG-3' в данном пике более чем в четыре раза превышает среднюю концентрацию этого динуклеотида в геноме. Другие эволюционно консервативные пики в последовательности miRNA локализуются в районе нуклеотидов 16 и 21. Пики концентрации сайта 5'-CNG-3 соответствуют нуклеотидам 4 и 8. Приблизительно половина последовательностей miRNA содержит два или больше сайтов 5'-CG-3' или 5'-CNG-3', расстояние между которыми в большинстве случаев составляет 1 или 3–9 нуклеотидов. Выводы. Пики концентрации сайтов 5'-CG-3' и 5'-CNG-3' не сосредоточены в пределах seed-участка, а распределены по всей длине последовательности miRNA. Однако в одной и той же молекуле miRNA данные сайты расположены в пределах одного витка двойной спирали. Такая картина распределения упомянутых сайтов может указывать на участие в miRNA-зависимом метилировании ДНК всей последовательности miRNA.

Ключевые слова: микроРНК, динуклеотид 5'-CG-3', тринуклеотид 5'-CNG-3', распределение сайтов