Biopolymers and cell. 2010; 26 (4): 279 - 285
Мобільний генетичний елемент Serratia marcescens, збудника хвороби цибулі
Л. П. Овчаренко, Т. М. Вознюк, І. Є. Заєць, А. І. Потопальський, О. Рева, Н. O. Kозировська
Мета. Перевірити наявність мобільних генетичних елементів (МГЕ) у бактерії, що яка спричиняє гниття вирощеної за польових умов цибулі, та вивчити інтегрон разом з асоційованими з ним касетами генів. Методи. Полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР) та секвенування продуктів ПЛР використано для ідентифікації бактерії та МГЕ. Метод аналізу поліморфізму довжини термінально мічених рестрикційних фрагментів ПЛР-продуктів застосовано для визначення ізольованої бактерії у тканинах цибулин. Результати. Аналізуючи послідовності нуклеотидів гена 16S рРНК ізоляту з гнилої цибулі, зроб- лено висновок про те, що бактерія належить до виду S. marcescens, відомого фітопатогену. Проте цей ізолят не реагував на специфічні праймери, характерні для фітопатогенних сератій. Інокулювання цибулі (Allium cepa L.), Arabidopsis thaliana (L.) Heyhn та салату (Lactuca sativa) призвело до зростання біомаси рослин без проявів симптомів захворювання. Інтегрон першого класу виявлено за допомогою ПЛР у геномі фітопатогенної S. marcescens вперше. Касети генів, які містили інтегрон, представлені безпромоторними генами, що кодують форміміноглутаматдеіміназу та фермент IIC аскорбатфосфотрансферазної системи, а також трьома некодуючими по- слідовностями, фланковами 59-п. н.-елементом. Висновки. S. marcescens IMBG291 проявляє патогенні властивості або стимулює розвиток рослини залежно від екологічної ситуації, завдяки горизонтально набутим генним касетам, розташованим на інтегроні.
Ключові слова: Serratia marcescens, гниття цибулі, інте- грон, генні касети