Метод белкового блотинга активно используется в молекулярно-биологических исследованиях для анализа взаимодействий типа белок — ДНК и белок — белок, включая определение специфичности антигенов и антител.
Рассмотрены различные этапы блотинга — перенос белков на мембраны, обработка блотов, создание иммунных комплексов на репликах и окрашивание блотов. Представлены два примера применения иммуноблотинга для анализа специфичности антител к интерферонам человека.